135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6696 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 410 aa  809    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  60.7 
 
 		 402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  52.66 
 
 		 408 aa  352  8e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  50.38 
 
 		 404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  38.11 
 
 		 406 aa  233  6e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  33.94 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  34.69 
 
 		 405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  31.44 
 
 		 399 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 421 aa  123  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  31.43 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  32.52 
 
 		 400 aa  117  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  29.55 
 
 		 422 aa  99.4  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  30.63 
 
 		 420 aa  93.2  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  26.87 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  28.49 
 
 		 479 aa  66.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 558 aa  60.5  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  27.78 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  25 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2662  putative transcriptional regulator, PucR family  29.02 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  35 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 462 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2412  hypothetical protein  37.41 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  50 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  50 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  40.51 
 
 		 528 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 517 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  25.87 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  50 
 
 		 428 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  36.67 
 
 		 412 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 365 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  41.46 
 
 		 447 aa  53.1  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  21.71 
 
 		 380 aa  53.1  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  52.08 
 
 		 428 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  52.08 
 
 		 428 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  52.08 
 
 		 428 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  47.92 
 
 		 429 aa  53.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  42.67 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  30.66 
 
 		 505 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  47.92 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  26.46 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  27.22 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  26.88 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  43.08 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  30.19 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  28.57 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  48.21 
 
 		 421 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  44.9 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  44.9 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  44.9 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  44.9 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  44.9 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  44.9 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  48.28 
 
 		 538 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 464 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  32.68 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  45.83 
 
 		 413 aa  50.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  44.9 
 
 		 410 aa  49.7  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2110  transcriptional regulator, CdaR  34.72 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  52.08 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  26.01 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  30.43 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2531  hypothetical protein  27.34 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  43.94 
 
 		 529 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13710  sugar diacid utilization regulator  31.71 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  34.39 
 
 		 491 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  35.53 
 
 		 511 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  46.43 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  32.88 
 
 		 379 aa  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  55.17 
 
 		 681 aa  47.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  46.43 
 
 		 501 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  45.83 
 
 		 554 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  33.56 
 
 		 515 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  45.83 
 
 		 554 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  33.56 
 
 		 515 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  45.45 
 
 		 525 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  45.83 
 
 		 554 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  33.56 
 
 		 515 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  41.67 
 
 		 514 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  45.45 
 
 		 429 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  37.31 
 
 		 616 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  46.43 
 
 		 393 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  28.77 
 
 		 515 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  47.92 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  26.11 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  53.49 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2428  putative transcriptional regulator, PucR family  28.57 
 
 		 563 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  32.88 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  44.07 
 
 		 543 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  36.26 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.11 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2578  transcriptional regulator, CdaR  32.38 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  58.54 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  38.03 
 
 		 558 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>