67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2712 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2712  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 401 aa  771    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2531  hypothetical protein  84.42 
 
 		 423 aa  607  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  40.6 
 
 		 393 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  41.74 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  50 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  49.33 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  26.72 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  50 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  50 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  23.37 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  50 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  30.77 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  27.9 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  28.32 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  44.44 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  27.92 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 393 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  41.89 
 
 		 418 aa  53.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  46.15 
 
 		 425 aa  53.9  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  46.24 
 
 		 397 aa  53.5  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  48.33 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  44.16 
 
 		 420 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  47.62 
 
 		 393 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  26.71 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 464 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  26.42 
 
 		 399 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7392  putative transcriptional regulator, PucR family  28.32 
 
 		 362 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  42.42 
 
 		 421 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  44.44 
 
 		 413 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  40 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  43.08 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  39.13 
 
 		 408 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  25.25 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  41.54 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  28.99 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  29.26 
 
 		 389 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 558 aa  47  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  41.89 
 
 		 492 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  43.94 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  43.48 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  37.33 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  41.27 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  31.46 
 
 		 493 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13710  sugar diacid utilization regulator  37.31 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  42.67 
 
 		 539 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  41.03 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  47.37 
 
 		 328 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  45.61 
 
 		 473 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  38.57 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  38.24 
 
 		 447 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  38.57 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  38.57 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  38.57 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  41.38 
 
 		 540 aa  43.9  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  38.57 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  38.57 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  38.57 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 479 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  26.75 
 
 		 495 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  41.25 
 
 		 485 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  27.57 
 
 		 398 aa  42.7  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  36.44 
 
 		 434 aa  43.1  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>