232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0602 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  100 
 
 		 410 aa  823    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  99.51 
 
 		 410 aa  816    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  95.85 
 
 		 410 aa  786    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  100 
 
 		 410 aa  823    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  99.76 
 
 		 410 aa  818    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  99.51 
 
 		 410 aa  816    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  100 
 
 		 410 aa  823    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  60.55 
 
 		 425 aa  471  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  56.97 
 
 		 405 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 405 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  56.46 
 
 		 389 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  52.57 
 
 		 405 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  49.45 
 
 		 311 aa  252  8.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  23.43 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  22.76 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 403 aa  90.1  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 305 aa  87  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 563 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  23.76 
 
 		 555 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  34.29 
 
 		 538 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  29.66 
 
 		 618 aa  80.9  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  36.55 
 
 		 525 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 537 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  27.85 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 524 aa  73.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  34.59 
 
 		 518 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  32.45 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 558 aa  70.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  31.03 
 
 		 520 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  27.37 
 
 		 740 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  36.64 
 
 		 525 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 586 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  32.86 
 
 		 609 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.13 
 
 		 509 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  32.48 
 
 		 585 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 553 aa  63.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  34.78 
 
 		 681 aa  63.5  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  31.43 
 
 		 491 aa  63.5  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  28.34 
 
 		 520 aa  63.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.51 
 
 		 601 aa  63.2  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  29.45 
 
 		 739 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  33.16 
 
 		 637 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 361 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  33.61 
 
 		 536 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  33.1 
 
 		 557 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  36 
 
 		 596 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  39.53 
 
 		 514 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  30.4 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  34.62 
 
 		 547 aa  60.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  30.89 
 
 		 505 aa  60.1  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  27.49 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  23.98 
 
 		 542 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 517 aa  60.1  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  31.79 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  31.65 
 
 		 741 aa  60.1  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  31.25 
 
 		 648 aa  59.7  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  32 
 
 		 558 aa  59.7  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  37.84 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  31.11 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  32.69 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  32.12 
 
 		 501 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  31.65 
 
 		 705 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  30 
 
 		 647 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  29.46 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  26.43 
 
 		 616 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  33.06 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  28.67 
 
 		 665 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  25.99 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  31.79 
 
 		 524 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  30.3 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  35.14 
 
 		 645 aa  57  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  25.82 
 
 		 562 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  33.04 
 
 		 534 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  18.86 
 
 		 381 aa  57  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4484  putative transcriptional regulator, PucR family  34.75 
 
 		 365 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.402234  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  29.45 
 
 		 614 aa  56.6  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  26.75 
 
 		 537 aa  56.2  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  31.67 
 
 		 515 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 552 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  29.55 
 
 		 353 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  32.59 
 
 		 493 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  28.16 
 
 		 553 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 546 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 597 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  22.49 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  26.7 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  33.62 
 
 		 566 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  27.39 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  33.68 
 
 		 616 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  26.67 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 564 aa  54.3  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  34.65 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  31.45 
 
 		 543 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  34.21 
 
 		 644 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  32 
 
 		 515 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>