136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0685 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  100 
 
 		 546 aa  1056    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  73.35 
 
 		 534 aa  746    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  62.26 
 
 		 536 aa  589  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  63.52 
 
 		 566 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  61.67 
 
 		 547 aa  551  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  55.58 
 
 		 575 aa  491  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 586 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  49.48 
 
 		 596 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  50.84 
 
 		 536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  39.45 
 
 		 542 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 542 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 542 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.28 
 
 		 523 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  37.52 
 
 		 535 aa  258  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  34.64 
 
 		 532 aa  249  9e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.26 
 
 		 533 aa  240  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  39.2 
 
 		 523 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  31.73 
 
 		 539 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  32.85 
 
 		 557 aa  164  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  30.43 
 
 		 530 aa  134  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.57 
 
 		 509 aa  130  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  40.98 
 
 		 500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  21.76 
 
 		 542 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  36.13 
 
 		 543 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 524 aa  104  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  28.05 
 
 		 504 aa  99.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  39.61 
 
 		 549 aa  97.8  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 553 aa  95.1  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  22.41 
 
 		 555 aa  94.7  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  28.76 
 
 		 520 aa  94.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  25.31 
 
 		 558 aa  92  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 235 aa  91.7  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 537 aa  91.7  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 549 aa  90.9  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  28.14 
 
 		 519 aa  88.2  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  29.87 
 
 		 558 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  27.33 
 
 		 537 aa  87  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  26.3 
 
 		 538 aa  85.1  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  36.84 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  34.3 
 
 		 582 aa  84  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  33.04 
 
 		 500 aa  83.2  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  39.06 
 
 		 236 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  37.2 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  27.48 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  37.31 
 
 		 531 aa  77.8  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  37.41 
 
 		 535 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  36.5 
 
 		 515 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  32.59 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  25.47 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 502 aa  70.9  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 517 aa  70.5  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 516 aa  70.1  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  31.25 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.77 
 
 		 601 aa  67.8  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  25.27 
 
 		 562 aa  67.8  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  37.19 
 
 		 598 aa  67.8  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  29.25 
 
 		 502 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  30.4 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.71 
 
 		 492 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.71 
 
 		 492 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.04 
 
 		 480 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  29.38 
 
 		 585 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.91 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  29.03 
 
 		 486 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  29.6 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  27.48 
 
 		 648 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  29.6 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  29.6 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.6 
 
 		 410 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.6 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.6 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 405 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  32.89 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  26.5 
 
 		 518 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 597 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  23.5 
 
 		 618 aa  58.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  31.4 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  25 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  25.19 
 
 		 627 aa  57  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.07 
 
 		 459 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  23.46 
 
 		 520 aa  57  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.85 
 
 		 445 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  27.04 
 
 		 645 aa  56.2  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  18.51 
 
 		 381 aa  56.2  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  24.54 
 
 		 501 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  24.28 
 
 		 740 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  25 
 
 		 739 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  38.95 
 
 		 665 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  27.66 
 
 		 619 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  26 
 
 		 525 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  30.71 
 
 		 412 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.71 
 
 		 412 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  34.64 
 
 		 454 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 429 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 552 aa  53.5  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 429 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 429 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 412 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  26.18 
 
 		 525 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>