90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0861 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 500 aa  972    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  28.6 
 
 		 549 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  37.36 
 
 		 534 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  44 
 
 		 582 aa  113  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  34.62 
 
 		 547 aa  107  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 546 aa  100  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 549 aa  100  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  37.64 
 
 		 536 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.61 
 
 		 509 aa  99.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  35.33 
 
 		 566 aa  99.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 586 aa  97.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  39.66 
 
 		 536 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.46 
 
 		 596 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  39.41 
 
 		 558 aa  91.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 235 aa  88.2  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  31.76 
 
 		 575 aa  86.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 535 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  41.61 
 
 		 539 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  37.68 
 
 		 532 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  36.72 
 
 		 236 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  32.02 
 
 		 557 aa  73.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  28.48 
 
 		 542 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  32.88 
 
 		 500 aa  71.6  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  43.07 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  36.55 
 
 		 531 aa  70.5  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  30 
 
 		 516 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 542 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 542 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  33.33 
 
 		 542 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 524 aa  63.9  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  35.54 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.17 
 
 		 523 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  26.28 
 
 		 537 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  34.86 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.42 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  31.69 
 
 		 609 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  26.19 
 
 		 562 aa  60.1  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.24 
 
 		 501 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.94 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  30.94 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  31.93 
 
 		 520 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  27.43 
 
 		 535 aa  58.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  37.17 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  28.14 
 
 		 555 aa  57.4  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  31.71 
 
 		 519 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  34.55 
 
 		 598 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  25.47 
 
 		 487 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 485 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.19 
 
 		 445 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  34.1 
 
 		 530 aa  53.5  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 537 aa  53.5  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  30.96 
 
 		 504 aa  53.5  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  41.76 
 
 		 558 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  28.09 
 
 		 505 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  36.36 
 
 		 425 aa  51.2  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  45.07 
 
 		 311 aa  51.2  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.85 
 
 		 492 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 502 aa  50.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 405 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.85 
 
 		 492 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  27.85 
 
 		 502 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  41.25 
 
 		 553 aa  47  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  41.43 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  41.43 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  41.43 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  41.43 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  26.27 
 
 		 353 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  25 
 
 		 459 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  41.43 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  41.43 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  41.43 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 477 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  27.92 
 
 		 538 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  26.67 
 
 		 543 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  30.43 
 
 		 501 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  43.28 
 
 		 637 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 405 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 416 aa  45.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  39.44 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  31.07 
 
 		 739 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  25.13 
 
 		 512 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  25.42 
 
 		 353 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  44.44 
 
 		 639 aa  44.3  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 312 aa  44.3  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 553 aa  43.9  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  35.62 
 
 		 740 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  30.32 
 
 		 403 aa  43.5  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>