119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1880 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  451  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  79.24 
 
 		 236 aa  361  6e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  36.84 
 
 		 534 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 535 aa  95.1  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  40.77 
 
 		 547 aa  90.5  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 546 aa  88.6  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  41.35 
 
 		 500 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  38.46 
 
 		 536 aa  85.5  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  40.98 
 
 		 582 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  31.75 
 
 		 537 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  39.26 
 
 		 557 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.91 
 
 		 523 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  36.92 
 
 		 566 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  38.74 
 
 		 549 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  38.85 
 
 		 532 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  39.62 
 
 		 519 aa  75.9  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  42.48 
 
 		 504 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 549 aa  75.1  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  36.36 
 
 		 542 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 542 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 542 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  38.18 
 
 		 558 aa  72.4  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 586 aa  72  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.23 
 
 		 596 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  39.84 
 
 		 536 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 524 aa  69.3  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  35.34 
 
 		 575 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 598 aa  68.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  36.89 
 
 		 515 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  33.62 
 
 		 609 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  34.78 
 
 		 538 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  34.38 
 
 		 539 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.43 
 
 		 601 aa  62.4  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  29.05 
 
 		 562 aa  62.4  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.68 
 
 		 509 aa  62  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  43.31 
 
 		 523 aa  62  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 537 aa  61.6  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  25.91 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  41.84 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  37.8 
 
 		 543 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.52 
 
 		 492 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  31.03 
 
 		 520 aa  59.3  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  32.5 
 
 		 520 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  35.21 
 
 		 478 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.97 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  45 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.64 
 
 		 533 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  29.06 
 
 		 558 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  35.34 
 
 		 505 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  23.48 
 
 		 555 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  32.46 
 
 		 486 aa  56.2  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 553 aa  56.2  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.88 
 
 		 445 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.5 
 
 		 459 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.04 
 
 		 480 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 516 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  44.57 
 
 		 458 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  32.5 
 
 		 485 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  33.98 
 
 		 535 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  34.07 
 
 		 412 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 429 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.07 
 
 		 412 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 429 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 429 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  31.54 
 
 		 500 aa  53.1  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 412 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  30.58 
 
 		 486 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.7 
 
 		 486 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.52 
 
 		 565 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 383 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  29.51 
 
 		 585 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  31.93 
 
 		 454 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  30.25 
 
 		 510 aa  48.9  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  29.91 
 
 		 410 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  37.63 
 
 		 562 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  34.94 
 
 		 487 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  32.26 
 
 		 531 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  32.46 
 
 		 481 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  35.78 
 
 		 530 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  36.71 
 
 		 483 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  37.66 
 
 		 479 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  47.54 
 
 		 425 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.02 
 
 		 501 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  32.61 
 
 		 739 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  33.77 
 
 		 525 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  36.78 
 
 		 438 aa  45.4  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7392  putative transcriptional regulator, PucR family  45.61 
 
 		 362 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 502 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  30.38 
 
 		 518 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  28.85 
 
 		 512 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  33.77 
 
 		 525 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 410 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  29.67 
 
 		 600 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  38.71 
 
 		 493 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 410 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  36.21 
 
 		 410 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  36.21 
 
 		 410 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  32.95 
 
 		 637 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>