256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0531 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 512 aa  1009    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  34.69 
 
 		 487 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 516 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.3 
 
 		 486 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  31.05 
 
 		 502 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.07 
 
 		 492 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.86 
 
 		 492 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  28.24 
 
 		 515 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  29.22 
 
 		 485 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  28.4 
 
 		 481 aa  96.3  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  25.94 
 
 		 478 aa  89.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.8 
 
 		 501 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  26.92 
 
 		 486 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  23.63 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  25.99 
 
 		 514 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  36.23 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  32.09 
 
 		 486 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  20.56 
 
 		 537 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  28.16 
 
 		 519 aa  74.7  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  26.17 
 
 		 558 aa  73.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  39.1 
 
 		 558 aa  73.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 552 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  25.93 
 
 		 555 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  39.13 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 553 aa  67.4  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.84 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  24.17 
 
 		 542 aa  66.6  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  40.74 
 
 		 413 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  43.24 
 
 		 525 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  41.89 
 
 		 525 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  42.25 
 
 		 705 aa  63.5  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  35.24 
 
 		 557 aa  63.5  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  39.51 
 
 		 505 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3621  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  37.08 
 
 		 384 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  36.99 
 
 		 510 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  34.71 
 
 		 598 aa  63.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  44.32 
 
 		 518 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  34.94 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  31.78 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  24.07 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  38.37 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  28 
 
 		 536 aa  60.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  25.93 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 586 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  40 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  38.04 
 
 		 385 aa  60.1  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  41.33 
 
 		 547 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  35.85 
 
 		 575 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  35.14 
 
 		 518 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  34.44 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  31.25 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  29.46 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  35.9 
 
 		 543 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  29.46 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.46 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.75 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  29.46 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  35.63 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.46 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.46 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0702  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  38.04 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  38.04 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  41.79 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  38.04 
 
 		 385 aa  57  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  38.04 
 
 		 385 aa  57  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  31.75 
 
 		 554 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  31.75 
 
 		 554 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  31.75 
 
 		 554 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  38.04 
 
 		 385 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  36.96 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  24.95 
 
 		 546 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  38.04 
 
 		 385 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  39.68 
 
 		 385 aa  56.6  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  38.04 
 
 		 385 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  41.79 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  38.04 
 
 		 385 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  36.96 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  36.96 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  23.36 
 
 		 534 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  38.04 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 659 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  38.04 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  36.96 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  34.38 
 
 		 483 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  36.96 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  38.46 
 
 		 491 aa  56.6  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1182  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  35.87 
 
 		 385 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  36.14 
 
 		 493 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3095  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  35.87 
 
 		 385 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  36.67 
 
 		 515 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  35 
 
 		 585 aa  55.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  31.17 
 
 		 412 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0150  transcriptional regulator, CdaR  34.38 
 
 		 384 aa  55.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>