More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_2125 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  100 
 
 
553 aa  1126    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
537 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  34.59 
 
 
538 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  33.7 
 
 
520 aa  286  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  33.21 
 
 
558 aa  255  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  29.89 
 
 
555 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  29.07 
 
 
585 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.4 
 
 
601 aa  202  9e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  34.38 
 
 
609 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  25.71 
 
 
618 aa  177  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  24.46 
 
 
562 aa  158  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  26.69 
 
 
525 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  26.51 
 
 
525 aa  148  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  27.91 
 
 
407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  25.34 
 
 
494 aa  127  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  23.48 
 
 
515 aa  123  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  26 
 
 
505 aa  121  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  26.54 
 
 
408 aa  120  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  24.91 
 
 
518 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  22.24 
 
 
542 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  22.14 
 
 
537 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  25.06 
 
 
563 aa  111  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  25.98 
 
 
665 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  25.08 
 
 
564 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
390 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  36.81 
 
 
705 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  28.03 
 
 
438 aa  105  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  27.55 
 
 
415 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  23.73 
 
 
514 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  23.96 
 
 
409 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  23.45 
 
 
566 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
305 aa  97.8  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  23.35 
 
 
546 aa  95.5  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  24.82 
 
 
406 aa  95.9  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  22.49 
 
 
536 aa  93.6  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  24.41 
 
 
554 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  23.89 
 
 
597 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.14 
 
 
501 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  22.41 
 
 
739 aa  91.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  22.14 
 
 
502 aa  92  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  24.21 
 
 
740 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  29.01 
 
 
543 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  22.35 
 
 
553 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  22 
 
 
492 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  21.63 
 
 
492 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  32.28 
 
 
616 aa  87.4  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
477 aa  87  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  27.12 
 
 
547 aa  87  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  23.36 
 
 
547 aa  86.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  26.65 
 
 
648 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  28.57 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  23.27 
 
 
602 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  23.2 
 
 
627 aa  84  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  32.17 
 
 
520 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  23.46 
 
 
614 aa  83.2  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  23.97 
 
 
616 aa  83.2  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  23.2 
 
 
534 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
659 aa  82.8  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
586 aa  82.8  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  22.73 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  25.3 
 
 
619 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  30 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  22.73 
 
 
510 aa  80.9  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  22.38 
 
 
514 aa  80.5  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  24.55 
 
 
650 aa  80.5  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  35 
 
 
552 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  30.57 
 
 
416 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  22.94 
 
 
493 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  21.51 
 
 
518 aa  77.8  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.79 
 
 
596 aa  77  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  23.35 
 
 
486 aa  77  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.86 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  24.84 
 
 
558 aa  75.1  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  30.67 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  31.19 
 
 
520 aa  74.7  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  32.64 
 
 
425 aa  74.7  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  30.38 
 
 
637 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  30 
 
 
520 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3095  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  33.13 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1182  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  32.53 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  28.95 
 
 
536 aa  73.6  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  18.98 
 
 
600 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  25.81 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  27.92 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  26.4 
 
 
575 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  24.2 
 
 
537 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  33.73 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  21.89 
 
 
532 aa  70.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  28.65 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  31.4 
 
 
515 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0702  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  26.89 
 
 
385 aa  69.7  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
516 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  35.51 
 
 
644 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.93 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  21.87 
 
 
645 aa  67.8  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.21 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.21 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.21 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>