243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0484 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 404 aa  835    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 403 aa  159  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  34.19 
 
 		 547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  27.43 
 
 		 406 aa  130  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  27.3 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  28.25 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  25.67 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  27.44 
 
 		 409 aa  99.4  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.21 
 
 		 601 aa  86.3  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  34.59 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  22.92 
 
 		 518 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 553 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  22.83 
 
 		 739 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  36 
 
 		 705 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  22.86 
 
 		 740 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  25.73 
 
 		 555 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  33.08 
 
 		 518 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  33.59 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  32.81 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  27.41 
 
 		 562 aa  73.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 563 aa  73.6  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 564 aa  73.2  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  28.02 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  24.29 
 
 		 525 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 477 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  30.28 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 659 aa  68.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.62 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  25.38 
 
 		 648 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  24.85 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  30.14 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  30.4 
 
 		 515 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  23.96 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  24.64 
 
 		 665 aa  63.5  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  29.77 
 
 		 609 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  26.09 
 
 		 619 aa  63.2  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  24.44 
 
 		 562 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  28.77 
 
 		 518 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 552 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  28.11 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  26.25 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2584  CdaR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  32.56 
 
 		 616 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  24.07 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  22.39 
 
 		 616 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2516  CdaR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.882452  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  29.29 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 597 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  36.25 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  25.57 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  29.53 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  30.65 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  31.43 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  24.36 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  27.87 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2682  CdaR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  30.4 
 
 		 585 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  33.06 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  33.06 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  33.06 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  33.06 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.06 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.06 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.06 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2528  transcriptional regulator, CdaR  34.96 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  30.66 
 
 		 650 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  24.59 
 
 		 637 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  28.95 
 
 		 602 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  40.74 
 
 		 553 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  30.09 
 
 		 645 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  26.56 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  36.59 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  29.93 
 
 		 547 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.59 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 412 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  23.93 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  24.21 
 
 		 627 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1774  putative sugar diacid utilization regulator  29.75 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.58 
 
 		 486 aa  56.6  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2428  putative transcriptional regulator, PucR family  23.84 
 
 		 563 aa  56.6  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  30.53 
 
 		 520 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  29.37 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  29.1 
 
 		 537 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  29.85 
 
 		 542 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1573  transcriptional regulator, CdaR  28.46 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  36.25 
 
 		 505 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 524 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2770  transcriptional regulator, CdaR  28.46 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0333515  hitchhiker  0.000000603935 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.58 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  28.12 
 
 		 644 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>