185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2522 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  100 
 
 		 616 aa  1258    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  50.93 
 
 		 600 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  40.98 
 
 		 602 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 597 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  20.62 
 
 		 739 aa  88.6  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 553 aa  87.4  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  18.92 
 
 		 740 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  28.21 
 
 		 645 aa  84.3  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  32.28 
 
 		 637 aa  78.2  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  34.36 
 
 		 514 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  25.59 
 
 		 627 aa  76.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  26.42 
 
 		 644 aa  74.3  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  22.57 
 
 		 648 aa  73.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  22.91 
 
 		 554 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  24.71 
 
 		 518 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  27.03 
 
 		 619 aa  72  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  31.87 
 
 		 562 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  26.29 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  31.03 
 
 		 705 aa  67.8  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  28.37 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  25.24 
 
 		 614 aa  65.1  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  22.27 
 
 		 665 aa  64.3  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  23.28 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  24.46 
 
 		 555 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 305 aa  62  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  39.13 
 
 		 511 aa  61.6  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  38.37 
 
 		 557 aa  61.6  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  35.94 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  27.57 
 
 		 520 aa  61.2  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  31.25 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  22.39 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  27.86 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 564 aa  59.3  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  32.93 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1604  putative GAF sensor protein  33.33 
 
 		 631 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  24.8 
 
 		 647 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  26.43 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  29.02 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  26.43 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  26.43 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  35.42 
 
 		 539 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  26.43 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  26.43 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  26.43 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  26.43 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  26.19 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 563 aa  57.4  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  30.77 
 
 		 616 aa  57.4  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  25.5 
 
 		 639 aa  56.2  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 410 aa  56.2  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1109  putative transcriptional regulator, PucR family  38.67 
 
 		 515 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 505 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.01 
 
 		 509 aa  55.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  35.38 
 
 		 530 aa  55.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  24.8 
 
 		 650 aa  55.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  47.37 
 
 		 458 aa  55.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 477 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  42.42 
 
 		 486 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  30.77 
 
 		 558 aa  54.3  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  30.15 
 
 		 609 aa  53.9  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.53 
 
 		 501 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  37.14 
 
 		 393 aa  53.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  21.96 
 
 		 408 aa  53.5  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  38.75 
 
 		 543 aa  53.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  28.42 
 
 		 493 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 524 aa  53.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  24.14 
 
 		 415 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 537 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 405 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  34.72 
 
 		 537 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  25.96 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 552 aa  52.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  33.33 
 
 		 540 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  35.82 
 
 		 510 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  37.31 
 
 		 425 aa  52  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 561 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  23.88 
 
 		 741 aa  52  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  28.06 
 
 		 311 aa  52  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  45.61 
 
 		 365 aa  51.6  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  35.38 
 
 		 514 aa  52  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 659 aa  52  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  37.31 
 
 		 514 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.24 
 
 		 445 aa  51.2  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  40.3 
 
 		 547 aa  51.2  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  33.85 
 
 		 529 aa  50.8  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  32.18 
 
 		 416 aa  50.8  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  31.33 
 
 		 530 aa  50.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  36.92 
 
 		 402 aa  50.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  41.82 
 
 		 392 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  22.75 
 
 		 383 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43380  carbohydrate diacid transcriptional regulator  46.94 
 
 		 367 aa  50.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251481  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.39 
 
 		 601 aa  49.7  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.14 
 
 		 486 aa  50.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.21 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.21 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  26.19 
 
 		 538 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>