113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2339 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 409 aa  833    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  55.26 
 
 		 408 aa  455  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  47.25 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  35.16 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  32.06 
 
 		 547 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  24.31 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 553 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  27.44 
 
 		 404 aa  99.4  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  26.74 
 
 		 558 aa  84.7  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  23.81 
 
 		 739 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  21.81 
 
 		 555 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  28.17 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  26.79 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  25.47 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  29.74 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  25.51 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  23.28 
 
 		 538 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  26.48 
 
 		 525 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  22.32 
 
 		 740 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 537 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  27.78 
 
 		 562 aa  63.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  23.22 
 
 		 601 aa  62.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 552 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  25.34 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 494 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.93 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  27.63 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  25.75 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  25 
 
 		 520 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  26.01 
 
 		 525 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  30.2 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  22.87 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  30.26 
 
 		 518 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  25.16 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2584  CdaR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 305 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  28.28 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  23.08 
 
 		 618 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  31.4 
 
 		 380 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  25 
 
 		 385 aa  54.3  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  35.8 
 
 		 519 aa  53.9  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  21.5 
 
 		 390 aa  53.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2516  CdaR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.882452  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2682  CdaR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  30.99 
 
 		 609 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 564 aa  53.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  21.21 
 
 		 585 aa  53.1  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  23.91 
 
 		 650 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  30.88 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 659 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  23.76 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  26.79 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03650  hypothetical protein  25 
 
 		 435 aa  50.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  28.57 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  28.57 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  29.52 
 
 		 414 aa  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  28.57 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1573  transcriptional regulator, CdaR  33.08 
 
 		 413 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 414 aa  49.7  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  28.17 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 384 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12395  hypothetical protein  29.45 
 
 		 437 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.537746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4050  putative carbohydrate diacid regulator  37.14 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0113  transcriptional regulator, CdaR  37.68 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2770  transcriptional regulator, CdaR  34.35 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0333515  hitchhiker  0.000000603935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  28.48 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1774  putative sugar diacid utilization regulator  32.79 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6844  putative regulator of polyketide synthase expression  31.37 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222986  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  23.92 
 
 		 554 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4083  putative carbohydrate diacid regulator  35.71 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.329455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 517 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11481  transcriptional activator protein  30.39 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.48079e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1607  transcriptional regulator, CdaR  34.09 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  27.27 
 
 		 514 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  25.2 
 
 		 371 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  26 
 
 		 371 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  37.18 
 
 		 515 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  20.93 
 
 		 518 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  26.99 
 
 		 383 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2528  transcriptional regulator, CdaR  32.28 
 
 		 387 aa  46.6  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1473  transcriptional regulator, CdaR  33.12 
 
 		 413 aa  46.6  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11218  hypothetical protein  32.58 
 
 		 421 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  27.38 
 
 		 371 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  28.57 
 
 		 485 aa  46.6  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  28.48 
 
 		 524 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  37.66 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  31.62 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  26.82 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2100  fis-type helix-turn-helix domain protein  23.97 
 
 		 287 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147633  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  24.22 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.8 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  26.56 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  33.02 
 
 		 353 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 563 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  21.97 
 
 		 741 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>