47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11218 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11218  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  847    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12395  hypothetical protein  63.7 
 
 		 437 aa  535  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.537746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11481  transcriptional activator protein  63.46 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.48079e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3869  putative transcriptional regulator, PucR family  46.27 
 
 		 405 aa  343  4e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.155401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2359  putative transcriptional regulator, PucR family  46.73 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6844  putative regulator of polyketide synthase expression  43.44 
 
 		 394 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222986  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2815  hypothetical protein  38.4 
 
 		 417 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.129951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2881  putative transcriptional regulator, PucR family  39.21 
 
 		 406 aa  264  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4444  putative transcriptional regulator, PucR family  31.18 
 
 		 438 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26290  regulator of polyketide synthase expression  27.19 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  26.42 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  27.93 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4213  hypothetical protein  26.42 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2857  putative transcriptional regulator, PucR family  29.43 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4621  hypothetical protein  24.85 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  30.07 
 
 		 558 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  25.7 
 
 		 407 aa  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4083  putative carbohydrate diacid regulator  30.51 
 
 		 375 aa  50.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.329455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  26.78 
 
 		 618 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0113  transcriptional regulator, CdaR  29.66 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  27.74 
 
 		 520 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4050  putative carbohydrate diacid regulator  29.66 
 
 		 375 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  27.9 
 
 		 525 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  32.58 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2592  carbohydrate diacid regulator (sugar diacid regulator)  27.27 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  29.8 
 
 		 525 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  27.15 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  27.15 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2728  transcriptional regulator, CdaR  27.15 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2687  transcriptional regulator, CdaR  27.15 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 408 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  28 
 
 		 601 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 537 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  31.73 
 
 		 538 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  24.23 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  29.57 
 
 		 585 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  24.79 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  32.63 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 552 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  30.83 
 
 		 609 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  25.58 
 
 		 359 aa  43.9  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  30.41 
 
 		 648 aa  43.5  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 517 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  27.81 
 
 		 740 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 405 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>