37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2881 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2881  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 
406 aa  798    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3869  putative transcriptional regulator, PucR family  52.63 
 
 
405 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.155401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2359  putative transcriptional regulator, PucR family  50.85 
 
 
438 aa  355  1e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11218  hypothetical protein  39.95 
 
 
421 aa  280  4e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12395  hypothetical protein  41.65 
 
 
437 aa  275  9e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.537746  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11481  transcriptional activator protein  40.05 
 
 
432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.48079e-25  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6844  putative regulator of polyketide synthase expression  39.27 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222986  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2815  hypothetical protein  35.16 
 
 
417 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.129951  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
416 aa  90.5  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26290  regulator of polyketide synthase expression  27.39 
 
 
441 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4444  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  29.82 
 
 
422 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  29.48 
 
 
408 aa  77  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4621  hypothetical protein  31.11 
 
 
430 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4213  hypothetical protein  27.36 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2857  putative transcriptional regulator, PucR family  33.73 
 
 
421 aa  56.2  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  32.84 
 
 
648 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  27.09 
 
 
518 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  33 
 
 
558 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4083  putative carbohydrate diacid regulator  28.24 
 
 
375 aa  47  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.329455 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  29.84 
 
 
425 aa  47  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  25 
 
 
618 aa  46.6  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4050  putative carbohydrate diacid regulator  27.48 
 
 
375 aa  46.6  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0113  transcriptional regulator, CdaR  28.91 
 
 
375 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  27.34 
 
 
311 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  20.61 
 
 
399 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  33.72 
 
 
410 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
405 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  31.63 
 
 
410 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.72 
 
 
410 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  33.72 
 
 
410 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.63 
 
 
410 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  31.63 
 
 
410 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  27.16 
 
 
398 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  33.72 
 
 
410 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  27.86 
 
 
409 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
564 aa  43.5  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>