158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20880 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  100 
 
 		 585 aa  1167    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  58.73 
 
 		 438 aa  435  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  45.47 
 
 		 538 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 537 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  41.92 
 
 		 609 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  42.33 
 
 		 520 aa  364  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.6 
 
 		 601 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  33.27 
 
 		 618 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 553 aa  230  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  26.85 
 
 		 558 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  23.94 
 
 		 555 aa  134  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  20.28 
 
 		 562 aa  125  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  22.78 
 
 		 542 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  21.88 
 
 		 537 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0676  hypothetical protein  48.31 
 
 		 170 aa  104  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.60111  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 494 aa  103  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  23.24 
 
 		 407 aa  93.6  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 515 aa  92.4  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  24.03 
 
 		 406 aa  90.1  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  22.39 
 
 		 739 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  22.87 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  31.79 
 
 		 520 aa  82  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  22.98 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  28.09 
 
 		 616 aa  80.5  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  23.77 
 
 		 525 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  27.25 
 
 		 647 aa  77.8  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  23.78 
 
 		 627 aa  77  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  32.1 
 
 		 558 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  26.02 
 
 		 557 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  26.35 
 
 		 665 aa  75.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  26.06 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  25.27 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  24.28 
 
 		 525 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 564 aa  72.8  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  26.46 
 
 		 619 aa  72.4  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  31.11 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  31.11 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  31.11 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.11 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.11 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.11 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.54 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.54 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  26.54 
 
 		 502 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  24.79 
 
 		 510 aa  70.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  25.23 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  24.72 
 
 		 518 aa  69.3  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  27.46 
 
 		 536 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  25.38 
 
 		 536 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 563 aa  68.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  27.78 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  33.88 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  29.89 
 
 		 547 aa  67.4  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.55 
 
 		 523 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 477 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  31.06 
 
 		 575 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  24.9 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  26.6 
 
 		 389 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 546 aa  63.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 405 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  26.16 
 
 		 562 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  30.94 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  31.4 
 
 		 705 aa  61.6  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.69 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  28.95 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  25.63 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  30 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  30.4 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  21.81 
 
 		 409 aa  60.1  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  24.58 
 
 		 359 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 390 aa  59.7  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  25 
 
 		 553 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.74 
 
 		 596 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 586 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  19.63 
 
 		 740 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  20.29 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  27.37 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  26.37 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  27.7 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  25.98 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  26.03 
 
 		 650 aa  58.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  25.51 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  25.98 
 
 		 645 aa  57.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.15 
 
 		 501 aa  57  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  24.42 
 
 		 376 aa  56.6  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  23.53 
 
 		 547 aa  57  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  34.29 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  29.71 
 
 		 491 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  29.7 
 
 		 481 aa  55.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  20.7 
 
 		 388 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  24.81 
 
 		 399 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  35 
 
 		 512 aa  55.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  25.98 
 
 		 380 aa  54.7  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  26.32 
 
 		 399 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 552 aa  54.7  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  26.49 
 
 		 637 aa  54.7  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>