206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3866 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 557 aa  1088    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  43.23 
 
 		 530 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  38.92 
 
 		 543 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 547 aa  187  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  32.03 
 
 		 536 aa  180  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  31.26 
 
 		 575 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  23.71 
 
 		 537 aa  174  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 586 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  32.28 
 
 		 539 aa  163  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  29.89 
 
 		 566 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  30.54 
 
 		 534 aa  160  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 546 aa  160  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  23.43 
 
 		 542 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.23 
 
 		 596 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 535 aa  156  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  31.87 
 
 		 536 aa  154  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  29.44 
 
 		 532 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  29.58 
 
 		 542 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 542 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 542 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.54 
 
 		 523 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 524 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  27.81 
 
 		 558 aa  126  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  22.04 
 
 		 555 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 537 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  39.53 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.26 
 
 		 509 aa  103  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  40.62 
 
 		 523 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  31.43 
 
 		 486 aa  99.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  26.5 
 
 		 520 aa  98.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 553 aa  97.4  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  25.95 
 
 		 558 aa  96.3  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  27.9 
 
 		 525 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  19.09 
 
 		 562 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  32.42 
 
 		 485 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  25.84 
 
 		 538 aa  91.3  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.08 
 
 		 533 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  28.92 
 
 		 519 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  27.36 
 
 		 525 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  26.42 
 
 		 585 aa  85.5  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 549 aa  82.8  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 516 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.56 
 
 		 601 aa  79.7  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 235 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  35.37 
 
 		 582 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 502 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  32.02 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  32.61 
 
 		 598 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 494 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  36.07 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  27.07 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  34.03 
 
 		 637 aa  73.9  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  37.01 
 
 		 236 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  42 
 
 		 619 aa  71.2  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  30.48 
 
 		 504 aa  70.9  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  27.97 
 
 		 492 aa  70.5  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  35.54 
 
 		 515 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  41 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  31.67 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  24.17 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  27.04 
 
 		 518 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  29.79 
 
 		 487 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  30.43 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  28.25 
 
 		 609 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 563 aa  67.8  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 517 aa  67  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  48.61 
 
 		 562 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  31.3 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  36.36 
 
 		 602 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  31.3 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.3 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  31.3 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.3 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  21.31 
 
 		 515 aa  63.9  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.3 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  35.24 
 
 		 512 aa  63.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  36.79 
 
 		 665 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  30.23 
 
 		 616 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  29.62 
 
 		 627 aa  62.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.78 
 
 		 486 aa  62  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.13 
 
 		 501 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  27.27 
 
 		 528 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  31.73 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.73 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.73 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.29 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  38.46 
 
 		 543 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  52.54 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  41.03 
 
 		 648 aa  58.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  36 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  19.6 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 597 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  34.09 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  36.9 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.9 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  34.83 
 
 		 600 aa  57  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  28.6 
 
 		 502 aa  57  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  37.35 
 
 		 614 aa  57  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>