157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4959 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 598 aa  1122    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  45.26 
 
 		 485 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  50.71 
 
 		 502 aa  177  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  42.11 
 
 		 481 aa  174  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  42.37 
 
 		 486 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 502 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  40.78 
 
 		 483 aa  160  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  43.48 
 
 		 558 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  45.81 
 
 		 491 aa  119  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.38 
 
 		 501 aa  118  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  38.33 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  36.03 
 
 		 504 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  35.93 
 
 		 519 aa  111  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  38.55 
 
 		 531 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  43.51 
 
 		 478 aa  107  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.98 
 
 		 480 aa  105  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  34.86 
 
 		 502 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 517 aa  97.1  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  48.99 
 
 		 456 aa  91.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.94 
 
 		 492 aa  90.5  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.94 
 
 		 492 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  39.76 
 
 		 515 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.53 
 
 		 565 aa  88.2  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  36.42 
 
 		 487 aa  87.8  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 516 aa  87  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  40.23 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.14 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.04 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  31.16 
 
 		 555 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  20.45 
 
 		 555 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 549 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  35.19 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.61 
 
 		 523 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  33.56 
 
 		 566 aa  72.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 586 aa  71.6  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  25.52 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  33.12 
 
 		 542 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 542 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 542 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  25.34 
 
 		 542 aa  70.9  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  33.56 
 
 		 536 aa  68.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  31.34 
 
 		 547 aa  68.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 535 aa  68.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  38.69 
 
 		 505 aa  67.8  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 552 aa  68.2  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 546 aa  67.4  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  40.5 
 
 		 501 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 558 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  44.19 
 
 		 525 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.88 
 
 		 596 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  43.75 
 
 		 520 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  29.67 
 
 		 575 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.62 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  34.07 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  36.67 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  31.85 
 
 		 532 aa  63.9  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  34.71 
 
 		 512 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 543 aa  62.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  40.4 
 
 		 549 aa  62.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  40.7 
 
 		 525 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  35.97 
 
 		 412 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.97 
 
 		 412 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  29.36 
 
 		 528 aa  62  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 557 aa  61.6  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  33.02 
 
 		 582 aa  61.6  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  36.54 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  32.3 
 
 		 536 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  29.9 
 
 		 609 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  30.52 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  26.28 
 
 		 410 aa  57  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  28.77 
 
 		 425 aa  56.6  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  26.71 
 
 		 534 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 553 aa  55.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  31.76 
 
 		 645 aa  55.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  34.55 
 
 		 500 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  34.12 
 
 		 413 aa  55.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.34 
 
 		 509 aa  54.7  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  38.26 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  37.84 
 
 		 493 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  28.18 
 
 		 515 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  25.64 
 
 		 410 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  34.18 
 
 		 602 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  25.64 
 
 		 410 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  25.64 
 
 		 410 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  37.97 
 
 		 514 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  34.21 
 
 		 543 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  39.29 
 
 		 409 aa  52.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  32.91 
 
 		 518 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  32.47 
 
 		 637 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  37.7 
 
 		 665 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  25.32 
 
 		 410 aa  51.6  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  25.32 
 
 		 410 aa  51.6  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  25.32 
 
 		 410 aa  51.6  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  42.17 
 
 		 414 aa  51.2  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  38.89 
 
 		 537 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>