166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0057 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  100 
 
 		 535 aa  1034    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  48.11 
 
 		 531 aa  343  5.999999999999999e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  32.57 
 
 		 486 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.78 
 
 		 565 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  31.73 
 
 		 555 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  33.4 
 
 		 483 aa  157  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  33.47 
 
 		 481 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.04 
 
 		 501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  38.33 
 
 		 598 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.85 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  29.92 
 
 		 504 aa  104  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  35.85 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  36.59 
 
 		 502 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  29.28 
 
 		 501 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.58 
 
 		 459 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  35.29 
 
 		 558 aa  89.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 502 aa  89.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.76 
 
 		 480 aa  88.2  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 478 aa  88.2  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  28.34 
 
 		 515 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 536 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 546 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 517 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  37.4 
 
 		 519 aa  75.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  34.33 
 
 		 566 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 516 aa  70.5  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  20.33 
 
 		 542 aa  70.1  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  40.82 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  35.96 
 
 		 547 aa  68.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.54 
 
 		 596 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 586 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  36.03 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 549 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  34.25 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  36.81 
 
 		 520 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  33.75 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.75 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.74 
 
 		 492 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 552 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  25.53 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.53 
 
 		 492 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  31.29 
 
 		 575 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  40.91 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 468 aa  60.1  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.81 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  38.76 
 
 		 582 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  42.67 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  34.68 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  27.43 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  36.03 
 
 		 561 aa  57.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  26.02 
 
 		 525 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  38.16 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  32.8 
 
 		 500 aa  56.6  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  41.46 
 
 		 515 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  36.97 
 
 		 549 aa  55.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 537 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  49.18 
 
 		 543 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  32.1 
 
 		 460 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  34.41 
 
 		 542 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 542 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 542 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  37.11 
 
 		 557 aa  54.3  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  33.06 
 
 		 425 aa  53.9  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  42.5 
 
 		 524 aa  53.5  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  21.9 
 
 		 537 aa  53.5  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 235 aa  53.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4118  putative transcriptional regulator, PucR family  42.05 
 
 		 498 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 535 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  45.83 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.42 
 
 		 486 aa  52.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.86 
 
 		 523 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  30.99 
 
 		 486 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  29.56 
 
 		 514 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 553 aa  52  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  37.61 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1437  CdaR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 371 aa  52  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  34.48 
 
 		 407 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  46.77 
 
 		 522 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  42.11 
 
 		 414 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 414 aa  51.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  47.37 
 
 		 479 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  39.44 
 
 		 515 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  39.44 
 
 		 515 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  39.44 
 
 		 515 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  31.1 
 
 		 514 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  41.46 
 
 		 562 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 383 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  32.18 
 
 		 554 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  32.45 
 
 		 518 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  36.46 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50790  hypothetical protein  39.02 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937212  hitchhiker  0.00694417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  34.07 
 
 		 510 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  32.04 
 
 		 236 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  29.13 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1640  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 488 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>