265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2063 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 561 aa  1040    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  38.88 
 
 		 501 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  34.38 
 
 		 505 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  34.45 
 
 		 543 aa  190  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  58.27 
 
 		 520 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 552 aa  134  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  51.08 
 
 		 514 aa  127  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  46.25 
 
 		 515 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  43.79 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  48.65 
 
 		 739 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  28.84 
 
 		 609 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.23 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  41.18 
 
 		 454 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  33.86 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 558 aa  78.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  41.77 
 
 		 517 aa  78.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  30.88 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  21.32 
 
 		 555 aa  76.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 477 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 403 aa  76.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.5 
 
 		 459 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  49.37 
 
 		 619 aa  75.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 563 aa  75.5  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  41.18 
 
 		 562 aa  73.9  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 659 aa  73.6  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  37.34 
 
 		 486 aa  72  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  46.15 
 
 		 647 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  40.15 
 
 		 515 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  28.66 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  49.33 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  40 
 
 		 535 aa  67.4  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  45.16 
 
 		 644 aa  67.4  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  51.28 
 
 		 531 aa  67  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 553 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  34.62 
 
 		 558 aa  66.6  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  42.48 
 
 		 485 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  36.43 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.39 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  38.1 
 
 		 614 aa  65.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  36.88 
 
 		 705 aa  64.7  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  42.03 
 
 		 537 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  39.22 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.22 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 502 aa  64.3  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  40.21 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  25.3 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  25.3 
 
 		 371 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  48.61 
 
 		 645 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 549 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  33.8 
 
 		 547 aa  63.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  28.26 
 
 		 518 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  31.82 
 
 		 407 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  26.47 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  26.47 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  47.44 
 
 		 639 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  26.47 
 
 		 371 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 429 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 429 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 429 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  44 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  25 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.03 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  43.06 
 
 		 637 aa  61.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  47.14 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  43.06 
 
 		 665 aa  60.8  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  40.43 
 
 		 519 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  25.68 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  43.59 
 
 		 478 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  43.1 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  44.3 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 528 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  29.58 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  40.51 
 
 		 525 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  44.94 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.22 
 
 		 601 aa  59.3  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.75 
 
 		 501 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  36.22 
 
 		 618 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  36.09 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  38.33 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  42.22 
 
 		 538 aa  58.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  32.47 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  43 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  31.01 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  41.67 
 
 		 648 aa  57.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  31.25 
 
 		 562 aa  57.4  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  37.19 
 
 		 553 aa  57  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  34.29 
 
 		 487 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 537 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  41.67 
 
 		 616 aa  56.6  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  35 
 
 		 512 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  44.44 
 
 		 420 aa  56.6  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  44.93 
 
 		 611 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  36.77 
 
 		 410 aa  56.2  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 384 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  40.23 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>