211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12040 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  100 
 
 		 393 aa  761    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  46.42 
 
 		 393 aa  298  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  46.54 
 
 		 386 aa  296  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  45.77 
 
 		 414 aa  291  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  45.65 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  45.61 
 
 		 421 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 403 aa  275  9e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  45.38 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  45.12 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  44.5 
 
 		 420 aa  260  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  45.33 
 
 		 393 aa  259  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  49.07 
 
 		 397 aa  258  9e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  47.77 
 
 		 413 aa  257  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  47.47 
 
 		 408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  46.65 
 
 		 373 aa  252  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  49.58 
 
 		 473 aa  252  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  45.23 
 
 		 419 aa  250  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 408 aa  250  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  45.74 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  41.67 
 
 		 429 aa  246  6.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  43.3 
 
 		 414 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  50.56 
 
 		 425 aa  242  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  45.8 
 
 		 384 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  44.36 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  42.22 
 
 		 428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  41.16 
 
 		 428 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  40.53 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  38.68 
 
 		 418 aa  229  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  40.82 
 
 		 539 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  41.32 
 
 		 428 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  41.32 
 
 		 428 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  41.32 
 
 		 428 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  43.57 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 479 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  41.84 
 
 		 276 aa  90.5  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  41.75 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 553 aa  61.6  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  31.82 
 
 		 246 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  43.08 
 
 		 518 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  33.06 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  23.33 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2339  hypothetical protein  20.64 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  45.45 
 
 		 480 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2197  transcriptional regulator, PucR family  37.68 
 
 		 540 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  32.3 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  25.19 
 
 		 387 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  25.19 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2728  transcriptional regulator, CdaR  25.19 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  37.62 
 
 		 398 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2687  transcriptional regulator, CdaR  25.19 
 
 		 387 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  46.27 
 
 		 478 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 305 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  33.12 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 390 aa  53.5  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  37.14 
 
 		 616 aa  53.1  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 555 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 563 aa  53.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2653  hypothetical protein  20.18 
 
 		 313 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  30.26 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  34.16 
 
 		 420 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 514 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  43.9 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  32.22 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  43.94 
 
 		 558 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.12 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  24.64 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  27.34 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  33.82 
 
 		 353 aa  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  33.82 
 
 		 353 aa  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  32.05 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 597 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  35.23 
 
 		 493 aa  49.7  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  41.46 
 
 		 501 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  37.61 
 
 		 520 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  35.38 
 
 		 600 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  33.15 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  33.73 
 
 		 558 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 361 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  30.37 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  41.27 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  47.92 
 
 		 561 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.27 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  40.32 
 
 		 537 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  39.78 
 
 		 553 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  35.14 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  35.14 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  39.74 
 
 		 517 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  39.68 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  41.67 
 
 		 562 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 659 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  44.29 
 
 		 540 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  55.81 
 
 		 385 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>