198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1305 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  100 
 
 		 540 aa  1031    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  45.4 
 
 		 554 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  45.4 
 
 		 554 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  45.4 
 
 		 554 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  44.87 
 
 		 538 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  45.73 
 
 		 525 aa  348  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  38.95 
 
 		 611 aa  292  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  39.48 
 
 		 512 aa  274  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  34.34 
 
 		 498 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  31.87 
 
 		 537 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  31.87 
 
 		 514 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  29.98 
 
 		 511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  30.47 
 
 		 530 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  32.99 
 
 		 529 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 532 aa  115  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  30.54 
 
 		 512 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  30.59 
 
 		 522 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  30.72 
 
 		 515 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  30.72 
 
 		 515 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  30.72 
 
 		 515 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  31.11 
 
 		 522 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  29.84 
 
 		 514 aa  102  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  30 
 
 		 547 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  30.54 
 
 		 510 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 410 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1496  putative transcriptional regulator, PucR family  31.44 
 
 		 502 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  24.94 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  22.28 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  28.64 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 558 aa  64.7  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  38.36 
 
 		 518 aa  62.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0789  putative transcriptional regulator, PucR family  25.81 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.691092  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  45.31 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  46.43 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  43.66 
 
 		 562 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  55.22 
 
 		 485 aa  57  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 553 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  35.14 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 464 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  42.59 
 
 		 382 aa  54.3  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  39.29 
 
 		 393 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  36.45 
 
 		 402 aa  54.3  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  45.61 
 
 		 365 aa  54.3  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  36.7 
 
 		 681 aa  53.9  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  36.62 
 
 		 421 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 425 aa  53.9  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 563 aa  53.9  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 468 aa  53.9  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  46.67 
 
 		 428 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  43.48 
 
 		 501 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  49.09 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  33.64 
 
 		 650 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  49.09 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  49.09 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  38.89 
 
 		 385 aa  53.5  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  39.39 
 
 		 600 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  38.36 
 
 		 413 aa  52.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  33.33 
 
 		 616 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  29.87 
 
 		 353 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  32.41 
 
 		 665 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  42.53 
 
 		 414 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  40.74 
 
 		 383 aa  52.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  44.78 
 
 		 481 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  30.53 
 
 		 514 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  34.87 
 
 		 543 aa  52  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  29.87 
 
 		 353 aa  52  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  43.1 
 
 		 418 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 552 aa  52  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  25.9 
 
 		 493 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.65 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  44.44 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  46.97 
 
 		 504 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  44.78 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  32.91 
 
 		 547 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  36.96 
 
 		 410 aa  51.6  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1109  putative transcriptional regulator, PucR family  32.05 
 
 		 515 aa  51.2  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  36.96 
 
 		 410 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 403 aa  51.6  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  38.27 
 
 		 389 aa  51.2  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  36.96 
 
 		 410 aa  51.6  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  36.96 
 
 		 410 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  36.96 
 
 		 410 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  36.96 
 
 		 410 aa  51.6  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  44.07 
 
 		 414 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  44.62 
 
 		 392 aa  51.2  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  36.96 
 
 		 410 aa  51.2  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  43.55 
 
 		 397 aa  51.2  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 516 aa  50.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  34.56 
 
 		 705 aa  50.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 414 aa  50.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  33.83 
 
 		 486 aa  50.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  44.83 
 
 		 411 aa  50.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  38.46 
 
 		 392 aa  50.8  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 305 aa  50.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 525 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  29.49 
 
 		 740 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  30.38 
 
 		 404 aa  50.4  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  37.97 
 
 		 417 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>