88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0789 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0789  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 421 aa  862    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.691092  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  32.04 
 
 		 518 aa  199  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2428  putative transcriptional regulator, PucR family  25 
 
 		 563 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03650  hypothetical protein  23.93 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  23.16 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1109  putative transcriptional regulator, PucR family  22.46 
 
 		 515 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  28.66 
 
 		 518 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  21.97 
 
 		 518 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  25.29 
 
 		 555 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1844  putative transcriptional regulator, PucR family  32.19 
 
 		 150 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000616925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  25.34 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0552  transcriptional regulator, CdaR  24.76 
 
 		 513 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 564 aa  64.3  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  21.46 
 
 		 741 aa  60.8  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  25.81 
 
 		 540 aa  60.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  24.91 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  29.93 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  21.64 
 
 		 305 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 524 aa  57  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  24.73 
 
 		 382 aa  57  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2528  transcriptional regulator, CdaR  27.78 
 
 		 387 aa  57  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  22.04 
 
 		 525 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 553 aa  56.6  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  23.03 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  26.06 
 
 		 558 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 659 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  19.72 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  30.56 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  22.36 
 
 		 740 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  20.27 
 
 		 375 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50790  hypothetical protein  24.62 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937212  hitchhiker  0.00694417 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  21.49 
 
 		 705 aa  51.2  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  20.82 
 
 		 525 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  20.9 
 
 		 516 aa  50.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  24.53 
 
 		 407 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 403 aa  50.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  17.47 
 
 		 553 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  21.99 
 
 		 554 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  20.74 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  23.57 
 
 		 520 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  23.64 
 
 		 650 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  19.85 
 
 		 600 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  23.78 
 
 		 505 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  26.47 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 361 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  22.67 
 
 		 399 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  20 
 
 		 552 aa  47.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.49 
 
 		 486 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  18.41 
 
 		 537 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  24.71 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  23.67 
 
 		 413 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  20.77 
 
 		 563 aa  46.6  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2516  CdaR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.882452  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  27.01 
 
 		 411 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2584  CdaR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2682  CdaR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 410 aa  46.6  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  28.77 
 
 		 627 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  19.48 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1774  putative sugar diacid utilization regulator  28.57 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  21.43 
 
 		 537 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 549 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  24 
 
 		 547 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  23.65 
 
 		 601 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.97 
 
 		 501 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1136  transcriptional regulator, CdaR  21.84 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  21.77 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  21.83 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.41 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  21.43 
 
 		 557 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  24.41 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  23.58 
 
 		 618 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1473  transcriptional regulator, CdaR  26.61 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 412 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4330  hypothetical protein  30.67 
 
 		 370 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123543  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2770  transcriptional regulator, CdaR  27.68 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0333515  hitchhiker  0.000000603935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 384 aa  43.9  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1573  transcriptional regulator, CdaR  27.43 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0265  putative carbohydrate diacid regulator  21.43 
 
 		 483 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18471  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  22.45 
 
 		 504 aa  43.5  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  26.76 
 
 		 515 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0175  carbohydrate diacid regulator  21.43 
 
 		 488 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  21.05 
 
 		 402 aa  43.5  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1640  putative transcriptional regulator  21.43 
 
 		 488 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  27.91 
 
 		 359 aa  43.1  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  28.77 
 
 		 512 aa  43.1  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  24.05 
 
 		 611 aa  43.1  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>