142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1109 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1109  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 515 aa  1066    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03650  hypothetical protein  21.72 
 
 		 435 aa  110  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  22.29 
 
 		 518 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  19.64 
 
 		 518 aa  94.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2428  putative transcriptional regulator, PucR family  21.48 
 
 		 563 aa  87  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  33.1 
 
 		 520 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0552  transcriptional regulator, CdaR  21.36 
 
 		 513 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0789  putative transcriptional regulator, PucR family  22.46 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.691092  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  29.94 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.5 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.5 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.5 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.5 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.5 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1844  putative transcriptional regulator, PucR family  27.2 
 
 		 150 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000616925  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  30.22 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  30.22 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  30.22 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  30.22 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  30.22 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  30.22 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  30.22 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0702  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.78 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  30.22 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 553 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  30.77 
 
 		 555 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.57 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  26.9 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  26.81 
 
 		 740 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1182  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.86 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.29 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  26.62 
 
 		 739 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3095  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.86 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  29.63 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 563 aa  58.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  43.1 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  24.85 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2070  transcriptional regulator, CdaR  24.48 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  25.95 
 
 		 402 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  28.26 
 
 		 382 aa  56.6  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  26.89 
 
 		 518 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  38.67 
 
 		 616 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3621  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.54 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  36.92 
 
 		 524 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1640  putative transcriptional regulator  30.83 
 
 		 488 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  25.83 
 
 		 522 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0265  putative carbohydrate diacid regulator  30.83 
 
 		 483 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18471  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 376 aa  53.9  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 537 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0175  carbohydrate diacid regulator  30.83 
 
 		 488 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 564 aa  53.5  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  29.05 
 
 		 389 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0203  carbohydrate diacid regulator  30.83 
 
 		 402 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2528  transcriptional regulator, CdaR  25.66 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 405 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  30.4 
 
 		 525 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  29.03 
 
 		 399 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  32.31 
 
 		 553 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  28.21 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  30.4 
 
 		 525 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  19.95 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  25.18 
 
 		 359 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  32.05 
 
 		 540 aa  51.2  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  25.17 
 
 		 383 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  28.57 
 
 		 413 aa  50.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  26.81 
 
 		 399 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  21.9 
 
 		 536 aa  50.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 514 aa  50.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  33.8 
 
 		 502 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2682  CdaR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250773 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  28.46 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.8 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  25 
 
 		 361 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.8 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22850  hypothetical protein  37.1 
 
 		 495 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.450672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  27.94 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  24.4 
 
 		 350 aa  49.3  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  36.92 
 
 		 493 aa  49.3  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.98 
 
 		 459 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  27.96 
 
 		 600 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  22.87 
 
 		 405 aa  48.5  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  34.78 
 
 		 537 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27560  regulatory helix-turn-helix protein, lysR family  19.27 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.144166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  27.94 
 
 		 616 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  32.84 
 
 		 619 aa  48.5  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1774  putative sugar diacid utilization regulator  28.35 
 
 		 407 aa  48.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  31.88 
 
 		 705 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  28.21 
 
 		 365 aa  48.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03504  sugar diacide regulator  28.57 
 
 		 168 aa  48.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  22.3 
 
 		 364 aa  48.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  32.86 
 
 		 504 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2516  CdaR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 410 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.882452  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 383 aa  47.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  24.48 
 
 		 438 aa  47.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  23.02 
 
 		 425 aa  47.4  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2584  CdaR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 410 aa  47  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>