98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2428 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2428  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 563 aa  1157    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  32.25 
 
 		 518 aa  275  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  24.42 
 
 		 520 aa  130  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0789  putative transcriptional regulator, PucR family  25 
 
 		 421 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.691092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1109  putative transcriptional regulator, PucR family  21.48 
 
 		 515 aa  90.5  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  21.28 
 
 		 518 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0552  transcriptional regulator, CdaR  22.05 
 
 		 513 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  24 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1844  putative transcriptional regulator, PucR family  26.81 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000616925  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03650  hypothetical protein  19.11 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  21.03 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  32.39 
 
 		 515 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  19.05 
 
 		 411 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  32.39 
 
 		 515 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  32.39 
 
 		 515 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  30.38 
 
 		 514 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  29.33 
 
 		 510 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  22.3 
 
 		 518 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 547 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  18.09 
 
 		 498 aa  54.7  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  17.32 
 
 		 412 aa  53.9  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  31.4 
 
 		 399 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  31.4 
 
 		 399 aa  53.5  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  23.08 
 
 		 555 aa  52.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.91 
 
 		 445 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  20.41 
 
 		 403 aa  51.6  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  22.73 
 
 		 616 aa  52  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  29.63 
 
 		 478 aa  52  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  29.58 
 
 		 529 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  30.49 
 
 		 412 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 412 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.49 
 
 		 412 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 429 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  36.07 
 
 		 419 aa  51.2  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  29.33 
 
 		 514 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  21.68 
 
 		 407 aa  51.2  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 429 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 429 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.16 
 
 		 379 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.86 
 
 		 480 aa  50.8  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 517 aa  50.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  35.48 
 
 		 394 aa  50.4  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  19.63 
 
 		 553 aa  50.4  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  29.33 
 
 		 511 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  28 
 
 		 644 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  26.67 
 
 		 650 aa  49.3  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  31.08 
 
 		 522 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  22.92 
 
 		 600 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  24.39 
 
 		 639 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.19 
 
 		 459 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  28.26 
 
 		 540 aa  48.5  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  35.09 
 
 		 528 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  30.77 
 
 		 522 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  35.09 
 
 		 739 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  23.48 
 
 		 705 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  30.77 
 
 		 637 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 564 aa  48.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  29.11 
 
 		 562 aa  48.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  30.77 
 
 		 421 aa  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  31.91 
 
 		 538 aa  47.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  19.69 
 
 		 516 aa  47  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  26.83 
 
 		 619 aa  47  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  23.21 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 515 aa  46.2  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  30.16 
 
 		 512 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 558 aa  47  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  27.1 
 
 		 493 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  20.73 
 
 		 546 aa  45.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  26.03 
 
 		 530 aa  45.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.92 
 
 		 486 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13710  sugar diacid utilization regulator  29.52 
 
 		 393 aa  45.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1846  putative transcriptional regulator, PucR family  27.54 
 
 		 86 aa  45.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  28.72 
 
 		 410 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  30.26 
 
 		 404 aa  45.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1604  putative GAF sensor protein  25.27 
 
 		 631 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  31.34 
 
 		 611 aa  45.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  21.48 
 
 		 609 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  35.29 
 
 		 491 aa  45.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0622  putative transcriptional regulator, PucR family  31.15 
 
 		 300 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  31.03 
 
 		 408 aa  45.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  16.71 
 
 		 415 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  22.22 
 
 		 525 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 552 aa  44.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  34.04 
 
 		 454 aa  44.3  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  23.08 
 
 		 558 aa  44.3  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  32.26 
 
 		 404 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  22.22 
 
 		 616 aa  44.3  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  31.25 
 
 		 397 aa  43.9  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  24.49 
 
 		 740 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  33.87 
 
 		 359 aa  43.9  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  24.62 
 
 		 537 aa  43.9  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 597 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  32.26 
 
 		 364 aa  43.5  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 537 aa  43.5  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  32.35 
 
 		 515 aa  43.5  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  27.5 
 
 		 665 aa  43.5  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>