137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27560 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_27560  regulatory helix-turn-helix protein, lysR family  100 
 
 		 413 aa  854    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.144166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0552  transcriptional regulator, CdaR  22 
 
 		 513 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  24.2 
 
 		 555 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  22.92 
 
 		 518 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  43.42 
 
 		 611 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  28.3 
 
 		 554 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4118  putative transcriptional regulator, PucR family  45.9 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  27.98 
 
 		 514 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 563 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  31.17 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1016  putative transcriptional regulator, PucR family  48.21 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13413  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  27.66 
 
 		 537 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 552 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 514 aa  53.5  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 305 aa  53.1  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  20.1 
 
 		 518 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  46.3 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  28.89 
 
 		 501 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  43.94 
 
 		 637 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1109  putative transcriptional regulator, PucR family  19.72 
 
 		 515 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  53.85 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  44 
 
 		 377 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  32.47 
 
 		 353 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  53.85 
 
 		 426 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  49.06 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  27.69 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  26.18 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  32.47 
 
 		 353 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 537 aa  50.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  30.66 
 
 		 418 aa  50.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  25.75 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  26.18 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 564 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  44.29 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 479 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  45.28 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  41.1 
 
 		 647 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  41.25 
 
 		 539 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  30.58 
 
 		 502 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  39.34 
 
 		 505 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  45 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  35.44 
 
 		 540 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  25.75 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  25.75 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  24.02 
 
 		 493 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  25.5 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  26.46 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  25.75 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.58 
 
 		 492 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.58 
 
 		 492 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  20.61 
 
 		 739 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 425 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  32.61 
 
 		 616 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  25.75 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  40.32 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  37.5 
 
 		 428 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  34.25 
 
 		 520 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  28.65 
 
 		 371 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  29.79 
 
 		 512 aa  47.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 558 aa  47  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  47.06 
 
 		 428 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  47.06 
 
 		 428 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  47.06 
 
 		 428 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 410 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1844  putative transcriptional regulator, PucR family  32.26 
 
 		 150 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000616925  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  50.98 
 
 		 400 aa  47  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0203  carbohydrate diacid regulator  48.84 
 
 		 402 aa  47  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  47.17 
 
 		 425 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  28.65 
 
 		 371 aa  47  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  48.89 
 
 		 518 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  27.61 
 
 		 400 aa  46.6  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.13 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  30.77 
 
 		 525 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  32.41 
 
 		 538 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  42.11 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  48.84 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  38.1 
 
 		 529 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03650  hypothetical protein  30.1 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  27.97 
 
 		 538 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  43.94 
 
 		 645 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  40.68 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  43.94 
 
 		 644 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  43.1 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  44.23 
 
 		 561 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  39.34 
 
 		 515 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1182  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  47.62 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  39.34 
 
 		 515 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  39.34 
 
 		 515 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  46.3 
 
 		 639 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03504  sugar diacide regulator  40.91 
 
 		 168 aa  45.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  28.07 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3095  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  47.62 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  40.91 
 
 		 543 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  43.48 
 
 		 365 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 515 aa  44.3  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>