240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3341 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 442 aa  858    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  38.73 
 
 		 402 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  38.57 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  35.48 
 
 		 383 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  36.62 
 
 		 375 aa  162  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  34.47 
 
 		 399 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  34.32 
 
 		 361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  23.04 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  26.02 
 
 		 411 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4484  putative transcriptional regulator, PucR family  31.41 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.402234  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  30.24 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3802  putative transcriptional regulator, PucR family  27.19 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  22.87 
 
 		 555 aa  90.9  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4011  transcriptional regulator  26.98 
 
 		 406 aa  90.5  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  30.37 
 
 		 554 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  30.37 
 
 		 554 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  30.37 
 
 		 554 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  32.96 
 
 		 518 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  28.24 
 
 		 538 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  28.35 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  28.87 
 
 		 525 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  32.45 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  32.45 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  32.45 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  32.45 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  32.45 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  32.45 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  28.15 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  34.69 
 
 		 739 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 563 aa  69.7  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 537 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  26.35 
 
 		 515 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  26.35 
 
 		 515 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  26.35 
 
 		 515 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  30.61 
 
 		 740 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  26.56 
 
 		 518 aa  66.6  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 553 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  31.38 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  34.72 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  32.39 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  26.92 
 
 		 522 aa  63.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 552 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  29.27 
 
 		 530 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 390 aa  63.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  29.2 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  26.44 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  23.08 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  37.65 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0150  transcriptional regulator, CdaR  32.02 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  32.37 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  29.02 
 
 		 616 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  28.06 
 
 		 542 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  26.01 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  26.54 
 
 		 514 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  26.53 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4083  putative carbohydrate diacid regulator  28.19 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.329455 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  28.79 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0113  transcriptional regulator, CdaR  28.57 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  25.9 
 
 		 537 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  43.42 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  27.41 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1109  putative transcriptional regulator, PucR family  43.1 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  34.04 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0175  carbohydrate diacid regulator  31.65 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1640  putative transcriptional regulator  31.65 
 
 		 488 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  29.41 
 
 		 425 aa  57  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0265  putative carbohydrate diacid regulator  31.65 
 
 		 483 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18471  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  27.75 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4050  putative carbohydrate diacid regulator  27.52 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0203  carbohydrate diacid regulator  30.43 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  30.29 
 
 		 502 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  29.37 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.29 
 
 		 492 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.29 
 
 		 492 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  26.81 
 
 		 520 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  30.85 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  43.55 
 
 		 384 aa  55.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.63 
 
 		 601 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  35.26 
 
 		 529 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  31.33 
 
 		 538 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  41.33 
 
 		 524 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  27.42 
 
 		 498 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  29.95 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22850  hypothetical protein  50.88 
 
 		 495 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.450672 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  28.78 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 564 aa  54.3  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  28.78 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  25.42 
 
 		 514 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  32.62 
 
 		 525 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 525 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 361 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2528  transcriptional regulator, CdaR  25.93 
 
 		 387 aa  54.3  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  41.94 
 
 		 393 aa  53.9  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>