More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1182 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 555 aa  1136    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 553 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  27.16 
 
 		 558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  26.44 
 
 		 562 aa  193  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  23.19 
 
 		 601 aa  169  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  24.32 
 
 		 538 aa  169  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  24.13 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  22.75 
 
 		 618 aa  141  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  22.75 
 
 		 537 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 563 aa  134  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  25.18 
 
 		 525 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 564 aa  130  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 403 aa  129  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  23.94 
 
 		 585 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  29.3 
 
 		 609 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  22.5 
 
 		 542 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  24.73 
 
 		 518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  23.37 
 
 		 525 aa  120  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  26.25 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 305 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  25.16 
 
 		 558 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 494 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  22.04 
 
 		 539 aa  107  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  23.56 
 
 		 536 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  26.71 
 
 		 740 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  22.63 
 
 		 534 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  22.48 
 
 		 739 aa  100  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  22.2 
 
 		 575 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  20.29 
 
 		 543 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  25.94 
 
 		 547 aa  97.4  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 586 aa  96.7  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  21.93 
 
 		 665 aa  97.1  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  24.11 
 
 		 547 aa  95.1  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  22.18 
 
 		 509 aa  92.8  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  28.44 
 
 		 412 aa  91.7  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  27.91 
 
 		 399 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  31.15 
 
 		 399 aa  92  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.17 
 
 		 596 aa  91.3  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  22.87 
 
 		 442 aa  90.9  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  21.5 
 
 		 705 aa  90.5  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  31.75 
 
 		 536 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  20.98 
 
 		 515 aa  88.6  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 546 aa  87.4  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  21.71 
 
 		 537 aa  87  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  21.78 
 
 		 650 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 477 aa  84.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  23.5 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  20.26 
 
 		 504 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  27.78 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  29.05 
 
 		 566 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  28.64 
 
 		 364 aa  83.2  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  23.4 
 
 		 486 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  20.92 
 
 		 552 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  21.77 
 
 		 619 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  21.54 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  25.69 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  23.76 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  23.76 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  23.76 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  23.76 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  23.76 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  23.76 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  28.71 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  25.73 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  34.23 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  21.56 
 
 		 547 aa  80.5  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  23.23 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  23.88 
 
 		 383 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  22.74 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  21.81 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  32 
 
 		 518 aa  77.8  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  20.56 
 
 		 616 aa  77.8  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  25.42 
 
 		 557 aa  77.8  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  29.17 
 
 		 562 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  25.85 
 
 		 415 aa  76.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 524 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  20.45 
 
 		 502 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  24.33 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 502 aa  75.1  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  24.28 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  21.9 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  21.52 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  32 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  21.18 
 
 		 519 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  27.88 
 
 		 505 aa  73.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  22.57 
 
 		 611 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  21.42 
 
 		 543 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  23.94 
 
 		 485 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  23.02 
 
 		 361 aa  73.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  19.35 
 
 		 554 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  21.66 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  26.44 
 
 		 388 aa  72  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  23.93 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  20 
 
 		 492 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  25 
 
 		 512 aa  72  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  30.77 
 
 		 520 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>