252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3511 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 411 aa  850    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  76.59 
 
 		 412 aa  648    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 410 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  27.18 
 
 		 530 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  27.09 
 
 		 511 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  28.67 
 
 		 537 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  26.02 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  25.12 
 
 		 515 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  27.1 
 
 		 514 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  25.12 
 
 		 515 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  25.12 
 
 		 515 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  26.46 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  26.89 
 
 		 529 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  24.36 
 
 		 399 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  23.02 
 
 		 518 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  26.94 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  25.06 
 
 		 375 aa  93.6  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  23.61 
 
 		 520 aa  89.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  25.31 
 
 		 498 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  24.15 
 
 		 514 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  25.95 
 
 		 522 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  28.17 
 
 		 512 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  21.07 
 
 		 562 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  27.78 
 
 		 555 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1496  putative transcriptional regulator, PucR family  25.31 
 
 		 502 aa  82.8  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  22.98 
 
 		 403 aa  82.8  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  34.4 
 
 		 518 aa  80.1  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  38.4 
 
 		 525 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  37.9 
 
 		 525 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  25.12 
 
 		 540 aa  76.3  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  26.29 
 
 		 407 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  24.18 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  23.08 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  24.19 
 
 		 538 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 532 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  28.75 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3802  putative transcriptional regulator, PucR family  22.09 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  29.2 
 
 		 520 aa  66.6  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  30.53 
 
 		 562 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 553 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  45.16 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  24.23 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  45.16 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  24.23 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  36.99 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  45.16 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  24.23 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  33.75 
 
 		 547 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3621  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.27 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  28.57 
 
 		 525 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.85 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  22.03 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.85 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  29.46 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  29.84 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.85 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  28.87 
 
 		 547 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.85 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.85 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  34.94 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  24.38 
 
 		 740 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  23.6 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  27.27 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  36.11 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0702  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.56 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  22.91 
 
 		 522 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3095  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.33 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  30 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  31.69 
 
 		 611 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 383 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1182  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.33 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0150  transcriptional regulator, CdaR  30.99 
 
 		 384 aa  59.7  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  27.56 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  27.56 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.56 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.56 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.56 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  27.56 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  32.65 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.31 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.56 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.56 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.56 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 563 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4050  putative carbohydrate diacid regulator  28.72 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  28.33 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  33.61 
 
 		 383 aa  57  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.33 
 
 		 486 aa  56.6  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0113  transcriptional regulator, CdaR  28.5 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  30.61 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  40.68 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2592  carbohydrate diacid regulator (sugar diacid regulator)  40.58 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4083  putative carbohydrate diacid regulator  28.21 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.329455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  29.13 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  40.68 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>