228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0637 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  100 
 
 		 486 aa  973    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  32.9 
 
 		 502 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.9 
 
 		 492 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.68 
 
 		 492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  31.42 
 
 		 515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  32.3 
 
 		 512 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  28.48 
 
 		 486 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 516 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  29.82 
 
 		 487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  26.39 
 
 		 491 aa  107  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  27.31 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  23.23 
 
 		 478 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.29 
 
 		 501 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  23.4 
 
 		 555 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  25.67 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  36.73 
 
 		 505 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  25.87 
 
 		 519 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 552 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  25.36 
 
 		 504 aa  77  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 563 aa  73.9  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  26.37 
 
 		 514 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  37.7 
 
 		 515 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  30.94 
 
 		 647 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03650  hypothetical protein  24.39 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  32.68 
 
 		 520 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  30.13 
 
 		 502 aa  67  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  31.62 
 
 		 598 aa  67  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  36.59 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.36 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  36.76 
 
 		 561 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 553 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  35 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  27.86 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  36.78 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  31.37 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  38.89 
 
 		 543 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 659 aa  64.3  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  29.37 
 
 		 740 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  35.37 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  25.86 
 
 		 528 aa  63.9  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  25.85 
 
 		 328 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 502 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  31.78 
 
 		 557 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  29.73 
 
 		 705 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  35.63 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  29.47 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  26 
 
 		 520 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  27.74 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  41.67 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  31.58 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  31.33 
 
 		 741 aa  60.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  30 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  30.87 
 
 		 558 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 538 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  28.42 
 
 		 537 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  35.58 
 
 		 739 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  43.06 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  32.14 
 
 		 665 aa  58.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  33.57 
 
 		 637 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  31.31 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  29.58 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  32.29 
 
 		 236 aa  56.6  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 411 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  30.08 
 
 		 493 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  28.48 
 
 		 525 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 376 aa  56.6  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  33.57 
 
 		 510 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  30.92 
 
 		 562 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  28.19 
 
 		 525 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  27.21 
 
 		 518 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  27.46 
 
 		 537 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 586 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.71 
 
 		 445 aa  54.3  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  25.86 
 
 		 518 aa  54.3  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  28.08 
 
 		 602 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2197  transcriptional regulator, PucR family  22.09 
 
 		 540 aa  53.9  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  37.11 
 
 		 447 aa  53.5  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  36.14 
 
 		 371 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  45.61 
 
 		 371 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.4 
 
 		 459 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0495  CdaR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 645 aa  53.5  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  28.42 
 
 		 535 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 564 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 361 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  27.34 
 
 		 562 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  36.84 
 
 		 644 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  33.57 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  33.1 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  45.61 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  39.13 
 
 		 380 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  43.86 
 
 		 371 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  43.86 
 
 		 371 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>