259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5712 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 537 aa  1040    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  52.21 
 
 		 547 aa  450  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  38.03 
 
 		 514 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  37.74 
 
 		 512 aa  248  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  36.92 
 
 		 511 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  36.56 
 
 		 529 aa  234  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  36.45 
 
 		 530 aa  209  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  36.77 
 
 		 515 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  36.77 
 
 		 515 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  36.77 
 
 		 515 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  35.28 
 
 		 522 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  34.59 
 
 		 611 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  38.32 
 
 		 510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1496  putative transcriptional regulator, PucR family  36.11 
 
 		 502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  35.58 
 
 		 514 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  34.84 
 
 		 512 aa  193  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 410 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  31.93 
 
 		 522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  29.04 
 
 		 538 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  30.7 
 
 		 540 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  29.59 
 
 		 554 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  29.59 
 
 		 554 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  29.59 
 
 		 554 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  31.16 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  26.19 
 
 		 412 aa  113  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  28.19 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 532 aa  101  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  27.36 
 
 		 558 aa  90.9  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  21.71 
 
 		 555 aa  87  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  27.55 
 
 		 525 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  27.53 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  31.92 
 
 		 665 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 553 aa  71.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  28 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  29.71 
 
 		 501 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  32.13 
 
 		 648 aa  69.7  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  30.91 
 
 		 647 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 563 aa  69.7  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 552 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  30.63 
 
 		 518 aa  68.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  20.96 
 
 		 739 aa  66.6  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  38 
 
 		 515 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  28.98 
 
 		 619 aa  64.7  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  42.42 
 
 		 561 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  42.25 
 
 		 514 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  43.66 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  30.53 
 
 		 616 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  31.11 
 
 		 645 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  33.7 
 
 		 637 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  40.26 
 
 		 543 aa  62  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  34.15 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  32.8 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  28.48 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  37.62 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  30.7 
 
 		 614 aa  60.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  26.44 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 564 aa  60.1  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  30.89 
 
 		 383 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  21.65 
 
 		 740 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  50.82 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  28.92 
 
 		 518 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  34.04 
 
 		 705 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  38.89 
 
 		 562 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  33.58 
 
 		 525 aa  57.4  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  28.19 
 
 		 407 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 547 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  36.62 
 
 		 413 aa  56.6  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50790  hypothetical protein  33.78 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937212  hitchhiker  0.00694417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  42.86 
 
 		 644 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.74 
 
 		 445 aa  56.6  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  45 
 
 		 418 aa  56.6  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  34.09 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  25.86 
 
 		 618 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  24.29 
 
 		 537 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  32.12 
 
 		 525 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.71 
 
 		 480 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.46 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  33.8 
 
 		 404 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  27.61 
 
 		 382 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 502 aa  55.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 600 aa  54.3  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  40.74 
 
 		 486 aa  54.3  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 390 aa  54.3  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  42.65 
 
 		 681 aa  54.3  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  28.24 
 
 		 538 aa  53.9  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 392 aa  53.9  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  32.39 
 
 		 493 aa  53.9  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  48.28 
 
 		 374 aa  53.5  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 376 aa  53.5  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27560  regulatory helix-turn-helix protein, lysR family  27.91 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.144166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  29.6 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  49.12 
 
 		 485 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  41.27 
 
 		 481 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  45.28 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  38.24 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>