More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2800 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 478 aa  962    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  87.08 
 
 		 480 aa  801    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  28.03 
 
 		 558 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  29.75 
 
 		 504 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  29.21 
 
 		 510 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.18 
 
 		 501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.41 
 
 		 445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  28.26 
 
 		 501 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 552 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  29.25 
 
 		 481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  29.23 
 
 		 505 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  48.74 
 
 		 485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  24.47 
 
 		 502 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.63 
 
 		 492 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.79 
 
 		 492 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  28.57 
 
 		 515 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  43.51 
 
 		 598 aa  106  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 516 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  27.63 
 
 		 543 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  43.42 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  24.73 
 
 		 558 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  41.8 
 
 		 486 aa  99  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  27.64 
 
 		 514 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 502 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  29.13 
 
 		 492 aa  97.8  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  24.74 
 
 		 486 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.04 
 
 		 486 aa  94  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.72 
 
 		 601 aa  92.8  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  33.9 
 
 		 491 aa  92  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  42.74 
 
 		 454 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  39.71 
 
 		 531 aa  90.5  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  25.94 
 
 		 512 aa  90.5  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  44.68 
 
 		 459 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  37.5 
 
 		 535 aa  87.8  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  26.99 
 
 		 543 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  21.54 
 
 		 555 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  37.04 
 
 		 519 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  25.25 
 
 		 520 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  46.28 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  34.73 
 
 		 515 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  27.29 
 
 		 575 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  23.09 
 
 		 538 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 546 aa  76.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  24.48 
 
 		 534 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  23.95 
 
 		 536 aa  76.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  40.61 
 
 		 502 aa  74.7  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  42.05 
 
 		 525 aa  73.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  27.5 
 
 		 487 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  40.91 
 
 		 525 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  33.96 
 
 		 547 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  34.9 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  30.86 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 586 aa  70.1  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  32.58 
 
 		 542 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.43 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  26.01 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 564 aa  67  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 659 aa  67  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  31.88 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  32.09 
 
 		 542 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 542 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 542 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 514 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  31.47 
 
 		 537 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  31.4 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  44.3 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  27.08 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  45.21 
 
 		 520 aa  64.7  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.07 
 
 		 565 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  42.11 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  31.45 
 
 		 566 aa  63.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 403 aa  63.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  30 
 
 		 596 aa  63.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  32.62 
 
 		 547 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  31.65 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  23.47 
 
 		 532 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  46.97 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  28.36 
 
 		 486 aa  60.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2197  transcriptional regulator, PucR family  33.08 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  31.17 
 
 		 627 aa  60.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  27.76 
 
 		 619 aa  60.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  31.79 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  38.04 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.04 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13710  sugar diacid utilization regulator  36.56 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  33.72 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  33.72 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  33.72 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 563 aa  60.1  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 553 aa  60.1  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  30.36 
 
 		 536 aa  60.1  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  36.84 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  28.66 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  36.89 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>