200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1023 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 518 aa  1051    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2428  putative transcriptional regulator, PucR family  32.25 
 
 		 563 aa  260  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0789  putative transcriptional regulator, PucR family  32.04 
 
 		 421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.691092  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  27.56 
 
 		 520 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0552  transcriptional regulator, CdaR  23.05 
 
 		 513 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  24.09 
 
 		 518 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03650  hypothetical protein  22.7 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  23.02 
 
 		 411 aa  96.7  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1109  putative transcriptional regulator, PucR family  22.29 
 
 		 515 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  19.85 
 
 		 412 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1844  putative transcriptional regulator, PucR family  37.1 
 
 		 150 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000616925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  22.92 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  32 
 
 		 555 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 553 aa  77.8  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  32.77 
 
 		 518 aa  77.8  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 564 aa  76.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 410 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 558 aa  74.3  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  21.94 
 
 		 740 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  28.06 
 
 		 383 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  26.35 
 
 		 538 aa  67.8  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  26.56 
 
 		 442 aa  66.6  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.43 
 
 		 601 aa  64.7  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  29.84 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  29.84 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  27.08 
 
 		 705 aa  62.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  30.25 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  23.26 
 
 		 665 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  24.05 
 
 		 739 aa  60.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.67 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  23.24 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  30.25 
 
 		 525 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  24.68 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  21.18 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1473  transcriptional regulator, CdaR  28.57 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  20.25 
 
 		 562 aa  57.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  28.03 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  26.09 
 
 		 637 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  24 
 
 		 619 aa  57  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  20.96 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  21.98 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  22.94 
 
 		 493 aa  57  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  22.6 
 
 		 375 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  27.39 
 
 		 353 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  23.62 
 
 		 514 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  29.93 
 
 		 415 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 563 aa  55.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  20.85 
 
 		 562 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  25.47 
 
 		 383 aa  55.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  25.62 
 
 		 350 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  26.67 
 
 		 537 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  25 
 
 		 361 aa  54.3  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1604  putative GAF sensor protein  27.83 
 
 		 631 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  22.5 
 
 		 616 aa  53.5  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2516  CdaR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.882452  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2584  CdaR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  25.85 
 
 		 520 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  18.48 
 
 		 514 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  21.5 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  25 
 
 		 644 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  26.88 
 
 		 611 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2682  CdaR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 410 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250773 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27560  regulatory helix-turn-helix protein, lysR family  20.1 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.144166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.86 
 
 		 459 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  28 
 
 		 639 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  24.5 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 517 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  51.06 
 
 		 359 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 597 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  27.91 
 
 		 627 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 305 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3621  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.62 
 
 		 384 aa  52  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  27.38 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2528  transcriptional regulator, CdaR  26.45 
 
 		 387 aa  52  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1774  putative sugar diacid utilization regulator  27.52 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  29.29 
 
 		 504 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  33.67 
 
 		 416 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  22.22 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.17 
 
 		 486 aa  51.2  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  34.21 
 
 		 454 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1607  transcriptional regulator, CdaR  27.52 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 515 aa  50.8  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2770  transcriptional regulator, CdaR  27.52 
 
 		 413 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0333515  hitchhiker  0.000000603935 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  25.81 
 
 		 364 aa  50.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3095  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  34.86 
 
 		 385 aa  50.4  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1182  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  34.86 
 
 		 385 aa  50.4  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  21.15 
 
 		 647 aa  50.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  20.44 
 
 		 537 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 659 aa  49.7  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  19.02 
 
 		 361 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  24 
 
 		 540 aa  50.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  21.89 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  27.98 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>