272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3926 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 399 aa  761    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  34.47 
 
 		 442 aa  163  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  33.1 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  30.88 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 383 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4011  transcriptional regulator  47.57 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3802  putative transcriptional regulator, PucR family  45.63 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  42.76 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  44.9 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  42.48 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  21.63 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  26.79 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  29.4 
 
 		 554 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  29.4 
 
 		 554 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  29.4 
 
 		 554 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  30.54 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  27.36 
 
 		 538 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  35.92 
 
 		 520 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  25.06 
 
 		 514 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  32.24 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  45.74 
 
 		 543 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 514 aa  63.5  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  32.61 
 
 		 739 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  34.59 
 
 		 558 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 528 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  33.6 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  33.75 
 
 		 538 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  47.69 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  49.15 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 563 aa  60.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  47.95 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  35.64 
 
 		 518 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  24.5 
 
 		 518 aa  60.1  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  42.11 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  29.63 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  35.53 
 
 		 501 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  46.15 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  46.58 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  26.23 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  37.14 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0676  hypothetical protein  40.4 
 
 		 170 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.60111  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  49.15 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  52.54 
 
 		 557 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  33.53 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  37.16 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  46.58 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 405 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  35.75 
 
 		 492 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  34.03 
 
 		 425 aa  57  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  53.45 
 
 		 530 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4484  putative transcriptional regulator, PucR family  35.92 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.402234  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.18 
 
 		 480 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  28.67 
 
 		 555 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 553 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  36.04 
 
 		 486 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  36.97 
 
 		 562 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  30.77 
 
 		 388 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  36.76 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.19 
 
 		 601 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  31.16 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  43.84 
 
 		 505 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  26.77 
 
 		 408 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  41.86 
 
 		 478 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  30.29 
 
 		 609 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  44.83 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  42.37 
 
 		 517 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  36.18 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  36.18 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  27.69 
 
 		 399 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  36.18 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  36.18 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  36.18 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  36.18 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 552 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  35.53 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  43.1 
 
 		 558 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  32.61 
 
 		 740 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  50 
 
 		 428 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  30.71 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  27.21 
 
 		 364 aa  53.5  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 384 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  33.75 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  33.76 
 
 		 422 aa  53.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 659 aa  53.1  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  47.22 
 
 		 400 aa  52.8  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  25.95 
 
 		 353 aa  53.1  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  34.53 
 
 		 505 aa  53.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3281  carbohydrate diacid regulator, putative  38.46 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  20.19 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  26.58 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 535 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>