283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3770 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 404 aa  823    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  34.34 
 
 		 739 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  34.59 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 553 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  29.07 
 
 		 547 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  36.3 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 564 aa  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  22.74 
 
 		 537 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  24.28 
 
 		 555 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  32.79 
 
 		 505 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  34.96 
 
 		 501 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  32.33 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  40.16 
 
 		 525 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  25.51 
 
 		 520 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  34.27 
 
 		 558 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  30.61 
 
 		 705 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  39.33 
 
 		 543 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  30.83 
 
 		 609 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  38.58 
 
 		 525 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  21.45 
 
 		 538 aa  69.7  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  33.09 
 
 		 616 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  32.87 
 
 		 562 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  30.15 
 
 		 561 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  30 
 
 		 520 aa  67.4  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  34.62 
 
 		 518 aa  66.6  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.02 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 552 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  29.14 
 
 		 740 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  30 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.22 
 
 		 601 aa  64.7  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  26.11 
 
 		 665 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  30.52 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  30.43 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  30.52 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  29.87 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  31.63 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 552 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  26.2 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  30.41 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  30.52 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  29.87 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  29.87 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  29.87 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  29.87 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.58 
 
 		 486 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  30.86 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  34.43 
 
 		 514 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  33.12 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  29.79 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  29.22 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  28.76 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 372 aa  59.7  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  30.2 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  26.28 
 
 		 515 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.87 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  32.65 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  32.65 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2578  transcriptional regulator, CdaR  25.45 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  31.25 
 
 		 537 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  19.93 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  30.53 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  33.96 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  27.91 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  35.63 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  42.47 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  26.06 
 
 		 619 aa  57.4  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  26.01 
 
 		 399 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 558 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 408 aa  57  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  34.15 
 
 		 493 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  34.95 
 
 		 425 aa  57  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  25.48 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  28.57 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  25.48 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  36.25 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.25 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  25.48 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.22 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  30.6 
 
 		 618 aa  56.6  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  36.84 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4083  putative carbohydrate diacid regulator  40 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.329455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  29.37 
 
 		 442 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.04 
 
 		 480 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0113  transcriptional regulator, CdaR  38.1 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4050  putative carbohydrate diacid regulator  38.1 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 517 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  33.8 
 
 		 537 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  35.21 
 
 		 511 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  27.92 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  20.29 
 
 		 585 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 659 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  29.68 
 
 		 542 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>