258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2598 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  100 
 
 		 511 aa  1003    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  74.71 
 
 		 514 aa  729    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  61.63 
 
 		 512 aa  591  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  62.92 
 
 		 529 aa  577  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  61.42 
 
 		 530 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  57.76 
 
 		 515 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  57.56 
 
 		 515 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  57.56 
 
 		 515 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  55.62 
 
 		 522 aa  508  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1496  putative transcriptional regulator, PucR family  55.29 
 
 		 502 aa  477  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  53.38 
 
 		 510 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  53.44 
 
 		 514 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  36.92 
 
 		 537 aa  244  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  34.29 
 
 		 547 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  30.88 
 
 		 611 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  31.6 
 
 		 522 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  32.69 
 
 		 512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  30.54 
 
 		 498 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  29.93 
 
 		 554 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  29.93 
 
 		 554 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  29.93 
 
 		 554 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  28.04 
 
 		 538 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  26.93 
 
 		 411 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  30.04 
 
 		 540 aa  113  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 532 aa  106  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  24 
 
 		 412 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  27.73 
 
 		 525 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  30.5 
 
 		 547 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  29.15 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  23.66 
 
 		 558 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  24.57 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  33.85 
 
 		 518 aa  63.5  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  42.65 
 
 		 514 aa  63.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  37.36 
 
 		 616 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  30.18 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  32.37 
 
 		 553 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  44.83 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  42.31 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  41.43 
 
 		 650 aa  60.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  29.45 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  35.16 
 
 		 600 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  37.12 
 
 		 616 aa  60.1  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  31.03 
 
 		 505 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  36 
 
 		 597 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 553 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  18.41 
 
 		 562 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  34.39 
 
 		 543 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.71 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  32 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  34.86 
 
 		 561 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 564 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 563 aa  58.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  27.39 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 514 aa  57  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  36.59 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  31.88 
 
 		 705 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  33.33 
 
 		 602 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  31.25 
 
 		 382 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  23.97 
 
 		 404 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  38.46 
 
 		 525 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3095  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.34 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.85 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 516 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  30.26 
 
 		 619 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  30.53 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  29.35 
 
 		 665 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2710  putative transcriptional regulator, PucR family  38.24 
 
 		 226 aa  55.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 403 aa  55.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1182  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.06 
 
 		 385 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  36.94 
 
 		 425 aa  55.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  32.8 
 
 		 385 aa  55.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2704  transcriptional regulator, CdaR  35 
 
 		 412 aa  54.7  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  24.05 
 
 		 739 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  37.04 
 
 		 644 aa  54.3  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  28.68 
 
 		 383 aa  54.3  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  27.52 
 
 		 519 aa  53.9  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  31.91 
 
 		 637 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  35.77 
 
 		 397 aa  53.9  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  35.9 
 
 		 501 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  36.43 
 
 		 393 aa  53.5  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  29.41 
 
 		 648 aa  53.5  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  27.44 
 
 		 361 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 659 aa  53.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  27.15 
 
 		 645 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  42.86 
 
 		 681 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  29.77 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  46.3 
 
 		 392 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 372 aa  52  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.77 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  44.62 
 
 		 473 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  29.77 
 
 		 385 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.77 
 
 		 385 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  29.77 
 
 		 385 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  42.67 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  36.99 
 
 		 414 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.77 
 
 		 385 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.77 
 
 		 376 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>