180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11210 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  63.99 
 
 		 554 aa  641    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  63.99 
 
 		 554 aa  641    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  63.99 
 
 		 554 aa  641    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  100 
 
 		 538 aa  1045    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  64.88 
 
 		 525 aa  597  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  44.51 
 
 		 540 aa  362  8e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  39.18 
 
 		 512 aa  289  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  37.96 
 
 		 611 aa  280  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  36.7 
 
 		 498 aa  213  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  29.23 
 
 		 537 aa  130  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 532 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  28.22 
 
 		 511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  29.1 
 
 		 512 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  28.54 
 
 		 522 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  27.32 
 
 		 514 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  28.92 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  27.49 
 
 		 530 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  29.6 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  29.6 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  29.61 
 
 		 515 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  29.74 
 
 		 547 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  27.07 
 
 		 514 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  27.62 
 
 		 510 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1496  putative transcriptional regulator, PucR family  29.96 
 
 		 502 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  21.46 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  32.2 
 
 		 522 aa  80.5  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  20.66 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  28.24 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  27.36 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  24.13 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  26.88 
 
 		 493 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  36.87 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  48.33 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  49.15 
 
 		 558 aa  60.5  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 514 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  63.04 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  63.04 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  63.04 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  50.85 
 
 		 460 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  45.61 
 
 		 365 aa  56.2  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  58.7 
 
 		 428 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  55.1 
 
 		 414 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  43.94 
 
 		 417 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  43.08 
 
 		 416 aa  54.7  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  31.36 
 
 		 402 aa  53.9  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  53.06 
 
 		 428 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  31.71 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  42.86 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  24.88 
 
 		 383 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4118  putative transcriptional regulator, PucR family  43.86 
 
 		 498 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  46.55 
 
 		 562 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  23.46 
 
 		 562 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  43.55 
 
 		 407 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  47.46 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  31.98 
 
 		 645 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  40.35 
 
 		 418 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  44.44 
 
 		 514 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  48.28 
 
 		 481 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  38.26 
 
 		 501 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  44.78 
 
 		 418 aa  51.2  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  38.2 
 
 		 429 aa  51.2  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 468 aa  51.2  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  41.79 
 
 		 558 aa  51.2  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  44.07 
 
 		 495 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 552 aa  50.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  50.98 
 
 		 415 aa  50.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  42.86 
 
 		 428 aa  50.8  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  51.85 
 
 		 397 aa  50.4  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  47.06 
 
 		 406 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  46.81 
 
 		 429 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  45.16 
 
 		 445 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  42.37 
 
 		 447 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  48.28 
 
 		 410 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  42.19 
 
 		 409 aa  50.1  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  38.67 
 
 		 393 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  42.62 
 
 		 609 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  41.56 
 
 		 681 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  39.73 
 
 		 421 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  48.89 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  49.25 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2528  transcriptional regulator, CdaR  29.93 
 
 		 387 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  43.86 
 
 		 425 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  42.86 
 
 		 404 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  40.66 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  41.43 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2412  hypothetical protein  54.55 
 
 		 386 aa  48.5  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  36.51 
 
 		 383 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 464 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  30.51 
 
 		 637 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  42.37 
 
 		 392 aa  48.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  48.15 
 
 		 419 aa  48.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  27.49 
 
 		 665 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 408 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  46 
 
 		 502 aa  48.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  44.64 
 
 		 413 aa  47.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  42.25 
 
 		 374 aa  47.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>