140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3963 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 429 aa  849    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  55.85 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  60.53 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  52.61 
 
 		 416 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  59.32 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  48.83 
 
 		 415 aa  332  8e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  42.23 
 
 		 479 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  40.55 
 
 		 411 aa  272  7e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  42.76 
 
 		 447 aa  242  9e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  44.99 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  43.86 
 
 		 420 aa  230  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 464 aa  189  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  36.65 
 
 		 495 aa  183  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  36.1 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  32.83 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  34.87 
 
 		 395 aa  150  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  33.94 
 
 		 416 aa  146  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  35.38 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  33.33 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  31.88 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  31.15 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  30.77 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  32.37 
 
 		 458 aa  99.8  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  45.45 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  30.09 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  38.81 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  27.7 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  27.1 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  29.94 
 
 		 558 aa  60.5  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 537 aa  59.7  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  38.52 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  28.02 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  26.27 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  44.87 
 
 		 681 aa  57  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  49.12 
 
 		 554 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  49.12 
 
 		 554 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  39.8 
 
 		 525 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  49.12 
 
 		 554 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  35.95 
 
 		 520 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  34.44 
 
 		 520 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  35.16 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  26.53 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  30.47 
 
 		 553 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  36.84 
 
 		 493 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  35.82 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 552 aa  53.5  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  35.46 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  44.07 
 
 		 538 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  25.13 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 659 aa  52.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  31.54 
 
 		 505 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  38.16 
 
 		 515 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  37.31 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  27.73 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  39.02 
 
 		 501 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 416 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  38.2 
 
 		 538 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 429 aa  50.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  27.56 
 
 		 389 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 403 aa  50.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 405 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  33.56 
 
 		 414 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  40.98 
 
 		 609 aa  50.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  41.1 
 
 		 529 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  35.78 
 
 		 543 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  25.87 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  40 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  35.38 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  44.07 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 514 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  26.09 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  26.96 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  45.76 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  32.12 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 383 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  28.12 
 
 		 558 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  32.58 
 
 		 557 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  30.68 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  40.91 
 
 		 537 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  45.45 
 
 		 528 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.12 
 
 		 486 aa  47.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  38.46 
 
 		 425 aa  47  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  34.67 
 
 		 486 aa  47  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  32.26 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  32.26 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  32.26 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  31.91 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 563 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  31.91 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.91 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  35.06 
 
 		 627 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  26.88 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>