184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4527 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  71.46 
 
 		 554 aa  693    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  71.46 
 
 		 554 aa  693    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  100 
 
 		 525 aa  1003    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  71.46 
 
 		 554 aa  693    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  65.67 
 
 		 538 aa  628  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  45.6 
 
 		 540 aa  353  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  38.56 
 
 		 512 aa  252  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  38.23 
 
 		 611 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  35.21 
 
 		 498 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 532 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  32.06 
 
 		 529 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  27.85 
 
 		 511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  28.04 
 
 		 530 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  27.89 
 
 		 512 aa  106  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  27.09 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  27.7 
 
 		 537 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  28.36 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  27.95 
 
 		 515 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  27.75 
 
 		 515 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  27.75 
 
 		 515 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  29.31 
 
 		 522 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  21.67 
 
 		 412 aa  91.3  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  28.81 
 
 		 510 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1496  putative transcriptional regulator, PucR family  30.44 
 
 		 502 aa  87  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  26.39 
 
 		 514 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  29.26 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  23.11 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  39.88 
 
 		 501 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  27.34 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  49.15 
 
 		 558 aa  63.9  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  34.27 
 
 		 514 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  50 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  54.24 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  45.31 
 
 		 547 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  52.46 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  40.54 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  52.54 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  52.54 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 514 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  26.35 
 
 		 383 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  48.21 
 
 		 365 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 464 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  42.05 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  39.8 
 
 		 429 aa  57  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  48.28 
 
 		 562 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  50 
 
 		 428 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 552 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  53.57 
 
 		 561 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  46.43 
 
 		 505 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  30.19 
 
 		 407 aa  55.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  43.42 
 
 		 393 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  44.07 
 
 		 392 aa  54.3  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  49.15 
 
 		 399 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  40.98 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  38.89 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 537 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  50 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1836  CdaR family transcriptional regulator  50 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  34.33 
 
 		 404 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  46.15 
 
 		 609 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  32.65 
 
 		 515 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  33.06 
 
 		 505 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  44.44 
 
 		 520 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  54.35 
 
 		 428 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  44.44 
 
 		 414 aa  52  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  44.07 
 
 		 447 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  47.37 
 
 		 415 aa  51.6  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  36.76 
 
 		 418 aa  51.2  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  54.35 
 
 		 428 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  54.35 
 
 		 428 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  54.35 
 
 		 428 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 429 aa  50.8  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  45 
 
 		 406 aa  50.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  50.88 
 
 		 543 aa  50.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4118  putative transcriptional regulator, PucR family  42.11 
 
 		 498 aa  50.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  35.71 
 
 		 404 aa  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22850  hypothetical protein  47.37 
 
 		 495 aa  50.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.450672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 425 aa  50.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  43.33 
 
 		 399 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  45 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2710  putative transcriptional regulator, PucR family  47.83 
 
 		 226 aa  49.7  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  36.51 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  46.94 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  46.77 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  33.64 
 
 		 402 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 477 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  36.36 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  45.61 
 
 		 538 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  45.07 
 
 		 393 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2412  hypothetical protein  48.15 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  38.71 
 
 		 413 aa  49.3  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  45.59 
 
 		 501 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  47.54 
 
 		 395 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  47.54 
 
 		 485 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  34.31 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  43.75 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4484  putative transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 365 aa  48.5  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.402234  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 385 aa  48.5  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>