231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23280 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  100 
 
 		 512 aa  1005    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  63.14 
 
 		 514 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  61.48 
 
 		 511 aa  578  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  62.84 
 
 		 529 aa  570  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  57.78 
 
 		 515 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  57.78 
 
 		 515 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  57.2 
 
 		 515 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  54.01 
 
 		 522 aa  495  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  58.01 
 
 		 530 aa  490  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  53.05 
 
 		 514 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  52.91 
 
 		 510 aa  458  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1496  putative transcriptional regulator, PucR family  51.86 
 
 		 502 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  37.43 
 
 		 537 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  35.01 
 
 		 547 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  30.52 
 
 		 611 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  32.32 
 
 		 512 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  32.7 
 
 		 522 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  32.17 
 
 		 498 aa  137  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  29.27 
 
 		 538 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  27.83 
 
 		 554 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  27.83 
 
 		 554 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  27.83 
 
 		 554 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  26.82 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  27.78 
 
 		 525 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  30.24 
 
 		 540 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 410 aa  97.1  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  24.23 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  28.61 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 532 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  30.13 
 
 		 614 aa  73.6  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 403 aa  66.6  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  28.16 
 
 		 519 aa  65.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  22.15 
 
 		 562 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  32 
 
 		 648 aa  63.9  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  30.71 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.04 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  33.88 
 
 		 562 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  26.72 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03650  hypothetical protein  38.03 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  44.93 
 
 		 485 aa  60.1  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  28.2 
 
 		 361 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  38.46 
 
 		 547 aa  58.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 564 aa  57  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  27.52 
 
 		 374 aa  57  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  45.59 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  29.48 
 
 		 553 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  44.78 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  50.77 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  47.54 
 
 		 411 aa  57  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  46.43 
 
 		 487 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  57.41 
 
 		 389 aa  56.6  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  52.73 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  48.44 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  53.57 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  33.64 
 
 		 375 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  27.61 
 
 		 413 aa  55.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  48.33 
 
 		 481 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 563 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  33.83 
 
 		 419 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 597 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  30.77 
 
 		 619 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  50.91 
 
 		 394 aa  55.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  37.24 
 
 		 400 aa  55.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  44 
 
 		 486 aa  54.7  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  45.07 
 
 		 501 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  43.64 
 
 		 276 aa  54.7  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  50 
 
 		 408 aa  54.3  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  42.47 
 
 		 486 aa  54.3  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  31.29 
 
 		 518 aa  53.9  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  41.49 
 
 		 397 aa  53.9  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  25.95 
 
 		 739 aa  53.9  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  29.6 
 
 		 405 aa  53.9  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  34.1 
 
 		 561 aa  53.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  50.91 
 
 		 425 aa  53.5  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  34.21 
 
 		 420 aa  53.5  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.13 
 
 		 480 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 517 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 552 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 505 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  34.09 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  47.76 
 
 		 681 aa  52.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  52.73 
 
 		 393 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  28.47 
 
 		 493 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  33.8 
 
 		 555 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  24.84 
 
 		 740 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  46.55 
 
 		 505 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  29.35 
 
 		 504 aa  52  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 468 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  49.09 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  46.15 
 
 		 598 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  40.58 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  29.1 
 
 		 403 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  33.33 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  30.03 
 
 		 665 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  43.94 
 
 		 417 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  32.47 
 
 		 404 aa  51.6  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  29.97 
 
 		 627 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>