225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0761 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 400 aa  775    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  55.3 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 408 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  47.19 
 
 		 405 aa  317  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  47.68 
 
 		 414 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  42.09 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  38.93 
 
 		 418 aa  210  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  33.95 
 
 		 422 aa  143  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 421 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  32.98 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  34.15 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  34.84 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  35.2 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  31.78 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  33.11 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2662  putative transcriptional regulator, PucR family  27.07 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  30.6 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  39.26 
 
 		 558 aa  70.1  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  43.8 
 
 		 505 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1016  putative transcriptional regulator, PucR family  31.6 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13413  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  33.59 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 563 aa  63.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  28.46 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  38.54 
 
 		 525 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 517 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  34.51 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  37.78 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  24.31 
 
 		 542 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  41.12 
 
 		 614 aa  60.1  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  24.74 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  31.36 
 
 		 665 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  37.65 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  27.51 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  31.9 
 
 		 645 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  33.82 
 
 		 637 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  36.31 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 558 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  24.67 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  30.45 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  27.25 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  26.93 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  40.85 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  36.67 
 
 		 528 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  24.14 
 
 		 537 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  28 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 552 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  30.28 
 
 		 648 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  40.54 
 
 		 505 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  40.79 
 
 		 384 aa  53.5  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 383 aa  53.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  29.17 
 
 		 393 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  37.86 
 
 		 328 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  35.51 
 
 		 486 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  33.54 
 
 		 393 aa  53.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  28.65 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  33.67 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 514 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  38.36 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  31.94 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  28.65 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  28.65 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  32.26 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.26 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.11 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  24.87 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  28.65 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.65 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.65 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.65 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  38.16 
 
 		 619 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  33.72 
 
 		 555 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2578  transcriptional regulator, CdaR  32.15 
 
 		 326 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.47 
 
 		 480 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  45.61 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  34.06 
 
 		 520 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  33.66 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  37.31 
 
 		 512 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  32.95 
 
 		 739 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  33.57 
 
 		 397 aa  51.2  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 553 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  38.66 
 
 		 524 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 403 aa  50.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  29.13 
 
 		 364 aa  50.4  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  34.33 
 
 		 365 aa  50.4  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.94 
 
 		 486 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.68 
 
 		 492 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 564 aa  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  37.23 
 
 		 543 aa  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  34.18 
 
 		 518 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  34.62 
 
 		 644 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.7 
 
 		 492 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  42.17 
 
 		 519 aa  49.7  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>