200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14120 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  100 
 
 		 397 aa  773    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  72.93 
 
 		 408 aa  543  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  75 
 
 		 419 aa  538  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  73.87 
 
 		 394 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  65.01 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  53.67 
 
 		 414 aa  385  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  53.92 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  49.6 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  51.19 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  51.85 
 
 		 392 aa  354  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 403 aa  349  5e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  53.05 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  51 
 
 		 420 aa  338  7e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  47.61 
 
 		 386 aa  335  7e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  50.13 
 
 		 421 aa  334  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  52.53 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  52.44 
 
 		 425 aa  320  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 408 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  52.7 
 
 		 373 aa  319  7e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  52.94 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  49.73 
 
 		 384 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  45.23 
 
 		 413 aa  290  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  47.79 
 
 		 393 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  42.79 
 
 		 539 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  44.56 
 
 		 429 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  44.27 
 
 		 418 aa  268  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  47.37 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  45.38 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  39.34 
 
 		 428 aa  243  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  38.96 
 
 		 428 aa  243  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  40.46 
 
 		 414 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  40.37 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  40.37 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  40.37 
 
 		 428 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 479 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  44.3 
 
 		 276 aa  119  7.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  45.87 
 
 		 453 aa  96.3  9e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  38.89 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  33.77 
 
 		 246 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  35.47 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  46.77 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  46.88 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  45.61 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  45.61 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  34.06 
 
 		 498 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  52.63 
 
 		 515 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  52.63 
 
 		 515 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  52.63 
 
 		 515 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 563 aa  53.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  52.73 
 
 		 529 aa  53.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  40.62 
 
 		 518 aa  53.1  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  32.47 
 
 		 371 aa  53.1  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 526 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 494 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  42.11 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  41.58 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  44.78 
 
 		 540 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.86 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  36.63 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  37.76 
 
 		 434 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 421 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  28.7 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  46.77 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  28.7 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  28.47 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  28.47 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  28.47 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  28.47 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 466 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  29.29 
 
 		 562 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  41.94 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  23.89 
 
 		 350 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  28.7 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 390 aa  50.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 377 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  54.76 
 
 		 431 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  36.36 
 
 		 447 aa  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0203  carbohydrate diacid regulator  35 
 
 		 402 aa  49.7  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  41.94 
 
 		 547 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  26.11 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0792  hypothetical protein  30 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.60027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  26.06 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  30.77 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  40.32 
 
 		 547 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  26.39 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  42.37 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  44.23 
 
 		 459 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  26.39 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  41.67 
 
 		 512 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  32 
 
 		 537 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2653  hypothetical protein  27.94 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  33.64 
 
 		 511 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.19 
 
 		 385 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2339  hypothetical protein  27.94 
 
 		 313 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 659 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>