256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1808 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 
397 aa  763    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  65.01 
 
 
397 aa  478  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  68.09 
 
 
408 aa  474  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  62.37 
 
 
419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  65.78 
 
 
394 aa  422  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  55.94 
 
 
414 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  55.06 
 
 
426 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  52.94 
 
 
393 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  55.05 
 
 
425 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  54.05 
 
 
420 aa  353  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  51.07 
 
 
403 aa  349  5e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  54.35 
 
 
404 aa  342  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  50.13 
 
 
392 aa  342  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  50.81 
 
 
400 aa  340  2e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  51.7 
 
 
421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  55.35 
 
 
373 aa  331  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  53.68 
 
 
425 aa  329  5.0000000000000004e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  50.67 
 
 
384 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  45.7 
 
 
386 aa  306  6e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  50.53 
 
 
473 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  50.27 
 
 
408 aa  295  7e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  42.23 
 
 
539 aa  287  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  45.26 
 
 
393 aa  283  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  45.09 
 
 
413 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  49.07 
 
 
393 aa  276  4e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  41.1 
 
 
429 aa  262  8.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  39.19 
 
 
418 aa  257  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  45.89 
 
 
429 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  41.67 
 
 
414 aa  249  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  41.73 
 
 
428 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  42.44 
 
 
428 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  42.44 
 
 
428 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  40.96 
 
 
428 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  42.44 
 
 
428 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  44.14 
 
 
479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  49.65 
 
 
276 aa  122  9e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  52.43 
 
 
453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
563 aa  73.2  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
494 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  43.81 
 
 
398 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  33.9 
 
 
387 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  33.03 
 
 
492 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  30.51 
 
 
418 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  37.79 
 
 
393 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
466 aa  60.1  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  33.57 
 
 
371 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  27.63 
 
 
616 aa  60.1  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 
637 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  33.79 
 
 
420 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
526 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
421 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  29.7 
 
 
418 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  39.29 
 
 
562 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  20.44 
 
 
381 aa  56.2  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 
611 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  39.6 
 
 
407 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  33.07 
 
 
383 aa  56.2  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  34.74 
 
 
246 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  37.59 
 
 
614 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  37.4 
 
 
554 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2197  transcriptional regulator, PucR family  39.71 
 
 
540 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  34.35 
 
 
558 aa  53.9  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  40.62 
 
 
407 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
390 aa  53.5  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  40.48 
 
 
406 aa  53.5  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  50.91 
 
 
529 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  33.03 
 
 
505 aa  52.8  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  41.86 
 
 
705 aa  52.8  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  57.78 
 
 
512 aa  53.1  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
553 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2712  transcriptional regulator, CdaR  46.24 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.42 
 
 
480 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  31.5 
 
 
422 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  38.78 
 
 
434 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  40.62 
 
 
518 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  33.93 
 
 
385 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  36.67 
 
 
512 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  21.89 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  59.09 
 
 
431 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  35.63 
 
 
493 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  33.57 
 
 
400 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  44.9 
 
 
376 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  32.81 
 
 
547 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  22.99 
 
 
364 aa  50.8  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  45.76 
 
 
554 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  43.55 
 
 
540 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2653  hypothetical protein  19.64 
 
 
313 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
468 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  45.76 
 
 
554 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  35.48 
 
 
350 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  39.34 
 
 
429 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  45.76 
 
 
554 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27560  regulatory helix-turn-helix protein, lysR family  49.06 
 
 
413 aa  50.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.144166  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  30.54 
 
 
412 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  33.33 
 
 
511 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  43.28 
 
 
478 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 
404 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  38.68 
 
 
395 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>