128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5059 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 395 aa  762    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  60.79 
 
 		 414 aa  431  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  62.77 
 
 		 389 aa  422  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  61.42 
 
 		 414 aa  418  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  57.29 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  46.41 
 
 		 412 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 464 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  41.77 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  38.35 
 
 		 495 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  39.44 
 
 		 430 aa  187  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  34.32 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  36.46 
 
 		 417 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  35.04 
 
 		 419 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  33.01 
 
 		 409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  37.09 
 
 		 416 aa  155  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  35.96 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  35.44 
 
 		 479 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  34.62 
 
 		 429 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  34.63 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  33.42 
 
 		 415 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  32.85 
 
 		 458 aa  86.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  50.47 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  30.06 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  30.02 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  32.52 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  27.78 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  29.24 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  29.31 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  29.45 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  39.56 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  37.68 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 558 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  41.46 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  41.46 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  42.68 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  41.46 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  26.74 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  30.03 
 
 		 399 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  36.89 
 
 		 421 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  28.36 
 
 		 407 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  27.3 
 
 		 402 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  37.78 
 
 		 414 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  41.25 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.53 
 
 		 501 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  37.93 
 
 		 428 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  38.68 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  42.31 
 
 		 485 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  34.41 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 425 aa  50.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 502 aa  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  40.74 
 
 		 408 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  33.64 
 
 		 392 aa  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  34.12 
 
 		 520 aa  49.7  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 384 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  43.33 
 
 		 529 aa  49.7  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  37.66 
 
 		 486 aa  49.7  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  27.45 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  47.54 
 
 		 525 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  31.83 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  30.23 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  36.79 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  41.79 
 
 		 554 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  41.79 
 
 		 554 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 429 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  41.79 
 
 		 554 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  29.66 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  40.3 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  38.36 
 
 		 535 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  34.78 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 468 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  44.78 
 
 		 502 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  34.91 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  46.67 
 
 		 598 aa  47  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  33.01 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 481 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  26.84 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  47.46 
 
 		 522 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  30.95 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  41.94 
 
 		 486 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  43.1 
 
 		 530 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  43.28 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.28 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.14 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.28 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  30.56 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  38.61 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  41.38 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  42.11 
 
 		 540 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  33.98 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 408 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1473  transcriptional regulator, CdaR  32.23 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 312 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  38.71 
 
 		 515 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  42.11 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 563 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  38.71 
 
 		 515 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>