192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5004 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 404 aa  788    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  61.28 
 
 		 408 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  50.39 
 
 		 410 aa  345  8e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  52.2 
 
 		 402 aa  326  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  36.54 
 
 		 406 aa  196  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  33.77 
 
 		 414 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  33.16 
 
 		 405 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  33.16 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  32.05 
 
 		 399 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  30.83 
 
 		 400 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  34.86 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 408 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  28.53 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 421 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  30.63 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  28.3 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  28.96 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  52.44 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  29.57 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  27.42 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  44.19 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  27.47 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  35.92 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  37.96 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  44.44 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  28.99 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  47.54 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  49.18 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 558 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  49.18 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  49.18 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  52.46 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  27.74 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  49.15 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  49.18 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  49.18 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  49.18 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  26.38 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  49.18 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  26.96 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  49.18 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  42.35 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  49.18 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  42.06 
 
 		 528 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  38.2 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  49.18 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  37.09 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  36.47 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  52.08 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  52.08 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  52.08 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  52.46 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  47.95 
 
 		 429 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  39.53 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  52.63 
 
 		 501 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  40 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  52.46 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 517 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  44.05 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2412  hypothetical protein  52.63 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  54.17 
 
 		 525 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  29.57 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  32.14 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  40.74 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  29.8 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  26.71 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 552 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  49.18 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  48.48 
 
 		 425 aa  53.9  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2662  putative transcriptional regulator, PucR family  26.71 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 563 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  26.71 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  52.08 
 
 		 538 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  49.12 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  47.54 
 
 		 429 aa  53.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  37.65 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  63.64 
 
 		 681 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1836  CdaR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  37.4 
 
 		 514 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  47.54 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  25.62 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  49.15 
 
 		 543 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  45.16 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  48.15 
 
 		 529 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 514 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  24.02 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  41.67 
 
 		 453 aa  51.6  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 498 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  49.18 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  29.6 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  49.12 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  26.28 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>