126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2411 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 417 aa  804    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  55.47 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  57.29 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 414 aa  350  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  53.02 
 
 		 414 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  46.77 
 
 		 412 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  37.31 
 
 		 495 aa  187  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  38.88 
 
 		 392 aa  186  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  38.52 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  36.25 
 
 		 417 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  37.66 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 429 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  36.1 
 
 		 429 aa  162  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  34.1 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  33.59 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  32.73 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  35.73 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  35.61 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  33.87 
 
 		 479 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  30.39 
 
 		 419 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  30.42 
 
 		 415 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  31.16 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  53.92 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  31.25 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  31.39 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  27.79 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  30.63 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  26.45 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  35.2 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  45.78 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  28.99 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 616 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  25.87 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  31 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  31.94 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  43.37 
 
 		 485 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  38.1 
 
 		 501 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 384 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  37.63 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2712  transcriptional regulator, CdaR  28.07 
 
 		 401 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  42.42 
 
 		 486 aa  50.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  30.99 
 
 		 515 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  36.17 
 
 		 420 aa  50.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  30.99 
 
 		 515 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  30.99 
 
 		 515 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  26.29 
 
 		 402 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  30.31 
 
 		 553 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  27.41 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  33.66 
 
 		 520 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  43.86 
 
 		 554 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  43.86 
 
 		 554 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  43.86 
 
 		 554 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 502 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  34.43 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  34.43 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  34.43 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  40.24 
 
 		 531 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  29.55 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  46.55 
 
 		 529 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  36.9 
 
 		 389 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  37.5 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  28.81 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 552 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 403 aa  47  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  43.55 
 
 		 525 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  27.78 
 
 		 405 aa  46.6  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  38.16 
 
 		 514 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  28.57 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 558 aa  46.6  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2412  hypothetical protein  35.64 
 
 		 386 aa  46.6  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 563 aa  46.6  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  37.5 
 
 		 535 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 537 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  37.04 
 
 		 562 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  52.08 
 
 		 512 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  33.73 
 
 		 487 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  33.14 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  28.26 
 
 		 512 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  35.26 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.99 
 
 		 501 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  37.8 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  34.09 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  47.37 
 
 		 517 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  23.53 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  40.98 
 
 		 511 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  36.08 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  26.94 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  36.05 
 
 		 393 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 609 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  45.61 
 
 		 543 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  46.55 
 
 		 530 aa  44.3  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  44.94 
 
 		 561 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  41.77 
 
 		 618 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>