154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2240 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 531 aa  988    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  48.87 
 
 		 535 aa  381  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  33.14 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.16 
 
 		 565 aa  149  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  32.32 
 
 		 555 aa  143  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  34.47 
 
 		 481 aa  116  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  37.36 
 
 		 485 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  38.15 
 
 		 598 aa  107  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  35.1 
 
 		 483 aa  98.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  37.33 
 
 		 502 aa  94  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 502 aa  93.2  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  39.71 
 
 		 478 aa  90.9  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.86 
 
 		 445 aa  90.9  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.02 
 
 		 480 aa  89  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  38.03 
 
 		 558 aa  87  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  30.02 
 
 		 546 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  32.49 
 
 		 519 aa  80.5  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  38.75 
 
 		 504 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  40.14 
 
 		 536 aa  75.5  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.94 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 517 aa  73.6  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 586 aa  73.6  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 549 aa  73.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  42.31 
 
 		 456 aa  73.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  32.84 
 
 		 566 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  43.01 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  36.55 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  35.56 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  34.33 
 
 		 536 aa  70.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.06 
 
 		 596 aa  70.9  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  29.93 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  31.03 
 
 		 547 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 516 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.52 
 
 		 501 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  37.88 
 
 		 582 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 535 aa  65.1  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  36.3 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  34.76 
 
 		 520 aa  63.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 552 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  41.38 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.38 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2857  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  48.72 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.9 
 
 		 486 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 561 aa  57  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  39.68 
 
 		 705 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  43.84 
 
 		 505 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  38.27 
 
 		 740 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  22.7 
 
 		 542 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  40.78 
 
 		 491 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  38.24 
 
 		 543 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  34.86 
 
 		 543 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  29.1 
 
 		 575 aa  53.9  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 414 aa  53.9  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  34.41 
 
 		 515 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  19.7 
 
 		 537 aa  53.5  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  34.69 
 
 		 549 aa  53.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  32.08 
 
 		 557 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  51.39 
 
 		 400 aa  53.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  43.75 
 
 		 538 aa  52.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  28.1 
 
 		 502 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  31.77 
 
 		 520 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.04 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.04 
 
 		 492 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  42.48 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 537 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  33.33 
 
 		 500 aa  51.2  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  41.56 
 
 		 409 aa  50.4  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  35.09 
 
 		 493 aa  50.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 553 aa  50.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 383 aa  50.4  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  35.29 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  41.1 
 
 		 515 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  42.67 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  41.56 
 
 		 501 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  44.16 
 
 		 609 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  39.74 
 
 		 510 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  41.46 
 
 		 389 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  30.15 
 
 		 328 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.77 
 
 		 523 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  37.08 
 
 		 385 aa  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 515 aa  47.8  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  37.14 
 
 		 523 aa  47.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  34.8 
 
 		 460 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  38.27 
 
 		 525 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  35.06 
 
 		 555 aa  47.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  37.08 
 
 		 385 aa  47.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  33.87 
 
 		 382 aa  47.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 235 aa  47.4  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  38.89 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  34.41 
 
 		 542 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  30.11 
 
 		 236 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 542 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4621  hypothetical protein  48.98 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  38.89 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>