75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1825 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  100 
 
 
523 aa  1030    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  67.12 
 
 
542 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  67.12 
 
 
542 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  67.12 
 
 
542 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  60.23 
 
 
533 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  45.01 
 
 
532 aa  364  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  40 
 
 
535 aa  282  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  39.85 
 
 
536 aa  276  4e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  38.43 
 
 
534 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  40.23 
 
 
566 aa  269  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
546 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.57 
 
 
596 aa  246  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  38.15 
 
 
586 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  39.18 
 
 
536 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  38.01 
 
 
547 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  38.16 
 
 
575 aa  227  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  38.01 
 
 
523 aa  217  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  31.02 
 
 
539 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  32.57 
 
 
543 aa  129  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  32.17 
 
 
557 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  22.63 
 
 
558 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.95 
 
 
509 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
524 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  20.44 
 
 
537 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  44.12 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
235 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  20.81 
 
 
542 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  31.61 
 
 
598 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
549 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  30.82 
 
 
549 aa  72.4  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  26.32 
 
 
520 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  33.51 
 
 
485 aa  70.5  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  29.71 
 
 
558 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  38.24 
 
 
582 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  23.12 
 
 
537 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  32.72 
 
 
530 aa  68.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
502 aa  68.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  34.19 
 
 
500 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  25 
 
 
486 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  21.53 
 
 
555 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  23.55 
 
 
585 aa  62  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  25.84 
 
 
538 aa  61.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.14 
 
 
480 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  35.42 
 
 
478 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  35.85 
 
 
500 aa  57.8  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
429 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
429 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
429 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
494 aa  55.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.08 
 
 
459 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  36.45 
 
 
504 aa  53.9  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  37.86 
 
 
535 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  22.73 
 
 
519 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  26.9 
 
 
481 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.23 
 
 
445 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  33.33 
 
 
515 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  21.58 
 
 
553 aa  51.2  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  29.41 
 
 
483 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  33.99 
 
 
502 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
517 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  30.77 
 
 
531 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  31.76 
 
 
454 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  25 
 
 
525 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  18.35 
 
 
562 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
412 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  31.11 
 
 
412 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.11 
 
 
412 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  23.02 
 
 
492 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  25.47 
 
 
616 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  23.02 
 
 
492 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  29.05 
 
 
518 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  23.02 
 
 
502 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  24.26 
 
 
619 aa  44.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  29.81 
 
 
491 aa  44.3  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  24.7 
 
 
627 aa  43.5  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>