148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3298 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 582 aa  1122    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 549 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  44.06 
 
 		 500 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  38.98 
 
 		 549 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.99 
 
 		 509 aa  89.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  34.08 
 
 		 534 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  36.54 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  35.85 
 
 		 543 aa  85.9  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  38.13 
 
 		 481 aa  85.1  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 535 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  36.18 
 
 		 566 aa  84  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 235 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  31.03 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  41.8 
 
 		 236 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  33.52 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  32.37 
 
 		 557 aa  80.5  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 524 aa  80.5  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 546 aa  79  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  33.52 
 
 		 547 aa  79.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 586 aa  77  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  39.1 
 
 		 536 aa  76.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  36.17 
 
 		 558 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  35.76 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.76 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  36.88 
 
 		 532 aa  74.7  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.5 
 
 		 596 aa  73.6  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  37.88 
 
 		 531 aa  71.6  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  31.76 
 
 		 575 aa  70.5  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.24 
 
 		 523 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  35 
 
 		 517 aa  70.1  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  33.86 
 
 		 485 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  26.59 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  32.58 
 
 		 542 aa  67.4  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 542 aa  67.4  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 542 aa  67.4  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  38.73 
 
 		 523 aa  67  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  32.77 
 
 		 504 aa  67.4  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 539 aa  66.6  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  26.16 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  30.11 
 
 		 520 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  30.56 
 
 		 609 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  34.62 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 502 aa  65.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  37.6 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.39 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  32.57 
 
 		 535 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  32.35 
 
 		 598 aa  61.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.43 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.06 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  27.27 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 553 aa  60.1  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  31.73 
 
 		 519 aa  58.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  30 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  30.41 
 
 		 585 aa  57.4  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  33.53 
 
 		 530 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  33.02 
 
 		 665 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  32.76 
 
 		 619 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  28.17 
 
 		 487 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  34.22 
 
 		 502 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  25 
 
 		 543 aa  54.3  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  42.62 
 
 		 616 aa  53.9  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  27 
 
 		 371 aa  53.9  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  27 
 
 		 371 aa  53.9  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  27 
 
 		 371 aa  53.9  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03504  sugar diacide regulator  34.95 
 
 		 168 aa  53.9  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  27 
 
 		 371 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  27.81 
 
 		 538 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 555 aa  53.5  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  32.53 
 
 		 648 aa  52.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 558 aa  52.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  28.95 
 
 		 410 aa  52.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.83 
 
 		 533 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  26 
 
 		 371 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 494 aa  52  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  36.36 
 
 		 515 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.65 
 
 		 565 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 305 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  43.75 
 
 		 374 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  27 
 
 		 371 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  32.37 
 
 		 425 aa  51.6  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  26 
 
 		 371 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  26 
 
 		 371 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  26 
 
 		 371 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  27.11 
 
 		 505 aa  50.4  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.33 
 
 		 486 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  37.14 
 
 		 520 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  26.19 
 
 		 520 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  27.66 
 
 		 502 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.66 
 
 		 492 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.66 
 
 		 492 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  30.69 
 
 		 525 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2687  transcriptional regulator, CdaR  24.43 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  24.43 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  24.43 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  31.71 
 
 		 600 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  32.5 
 
 		 637 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>