184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1876 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 487 aa  942    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 516 aa  625  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  34.69 
 
 		 512 aa  239  5.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  33.54 
 
 		 502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.06 
 
 		 492 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.85 
 
 		 492 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  31.98 
 
 		 515 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.57 
 
 		 486 aa  147  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  31.59 
 
 		 486 aa  146  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  29.96 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  45 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.84 
 
 		 501 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 517 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  46.67 
 
 		 558 aa  103  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  28.79 
 
 		 485 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  26.53 
 
 		 478 aa  100  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  25.59 
 
 		 558 aa  99.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  26.93 
 
 		 504 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.73 
 
 		 480 aa  97.1  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  32.8 
 
 		 502 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  28.95 
 
 		 510 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  26.51 
 
 		 536 aa  90.9  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  39.37 
 
 		 598 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  36.78 
 
 		 486 aa  87.4  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  42.98 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.11 
 
 		 596 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  26.14 
 
 		 534 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  28.67 
 
 		 547 aa  81.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.92 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 546 aa  74.7  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 586 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  28.21 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 502 aa  71.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  25.14 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  33.52 
 
 		 531 aa  70.5  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  30 
 
 		 542 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  31.64 
 
 		 609 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  25.81 
 
 		 543 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  27.9 
 
 		 543 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  34.84 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.84 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.26 
 
 		 565 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  27.2 
 
 		 410 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  26.45 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  30.04 
 
 		 557 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  26.92 
 
 		 528 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  27.78 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  37.78 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  34.68 
 
 		 535 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  42.47 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  23.95 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  27.12 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  39.08 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  46.43 
 
 		 512 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  27.74 
 
 		 413 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  25.75 
 
 		 562 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  24.8 
 
 		 410 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 537 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 553 aa  55.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 549 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  25.47 
 
 		 500 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  24.8 
 
 		 410 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  24.8 
 
 		 410 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  35.8 
 
 		 582 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  35.96 
 
 		 501 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  30.77 
 
 		 549 aa  55.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  35 
 
 		 616 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 305 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 390 aa  54.3  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  44.59 
 
 		 553 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 659 aa  54.3  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  34.4 
 
 		 618 aa  54.3  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  30.37 
 
 		 406 aa  54.3  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  31.08 
 
 		 411 aa  53.9  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0789  putative transcriptional regulator, PucR family  22.97 
 
 		 421 aa  53.9  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.691092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  32.35 
 
 		 412 aa  53.5  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  24 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  38.55 
 
 		 562 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  24 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  24 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  41.05 
 
 		 420 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  31.06 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  39.29 
 
 		 619 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  24.83 
 
 		 399 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  31.76 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  42.03 
 
 		 431 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  21.59 
 
 		 555 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  29.47 
 
 		 614 aa  50.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 384 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 535 aa  50.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  40.28 
 
 		 705 aa  50.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 403 aa  50.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  32 
 
 		 491 aa  50.4  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.59 
 
 		 459 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  24.14 
 
 		 399 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>