More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1388 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 543 aa  1053    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  40.29 
 
 		 501 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  35.98 
 
 		 505 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 552 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  37 
 
 		 520 aa  233  7.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  35.27 
 
 		 514 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  32.43 
 
 		 515 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  46.47 
 
 		 486 aa  127  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  28 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.12 
 
 		 480 aa  103  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  28.62 
 
 		 502 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.65 
 
 		 492 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.65 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  37.39 
 
 		 517 aa  92.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  38.73 
 
 		 561 aa  89.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.32 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 429 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 429 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 429 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  21.39 
 
 		 555 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  43.82 
 
 		 558 aa  77.8  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  32.75 
 
 		 665 aa  76.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  29.51 
 
 		 525 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.23 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  33.97 
 
 		 525 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  38.93 
 
 		 705 aa  74.3  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  29.91 
 
 		 483 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  35 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  39.33 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  25.06 
 
 		 403 aa  70.1  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  48.75 
 
 		 645 aa  69.7  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 502 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  37.59 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 553 aa  68.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.51 
 
 		 565 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  31.27 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  27.15 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 564 aa  66.6  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  43.84 
 
 		 515 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  25.83 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  46.43 
 
 		 644 aa  65.1  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  33.7 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  33.7 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  33.7 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  49.28 
 
 		 502 aa  65.1  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  34.78 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  33.7 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  34.78 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.89 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  32.4 
 
 		 648 aa  63.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0495  CdaR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  40.19 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  36.05 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  38.52 
 
 		 609 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  40.51 
 
 		 518 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  38.19 
 
 		 637 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  29.16 
 
 		 539 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  27.32 
 
 		 598 aa  62  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 516 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  40.7 
 
 		 371 aa  62  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  40.26 
 
 		 537 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  29.11 
 
 		 555 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  33.55 
 
 		 511 aa  61.2  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  39.47 
 
 		 558 aa  60.8  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  39.08 
 
 		 650 aa  60.5  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  30.31 
 
 		 627 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  34.1 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  34.07 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  38.46 
 
 		 557 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.07 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  24.83 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 659 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  34.87 
 
 		 540 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 514 aa  59.3  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  33.67 
 
 		 485 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  40.57 
 
 		 553 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  35.9 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  25.59 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  39.34 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  42.86 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  49.15 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  42.05 
 
 		 639 aa  58.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  44.12 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  30.64 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  43.66 
 
 		 611 aa  57.4  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  27.34 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  40.32 
 
 		 739 aa  57.8  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  37.04 
 
 		 400 aa  57  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  31.29 
 
 		 410 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  38.04 
 
 		 538 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0702  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  26.62 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>