221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5254 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 415 aa  800    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 564 aa  119  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 553 aa  106  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  40.1 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 305 aa  93.2  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 403 aa  92.8  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 563 aa  87  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  30.9 
 
 		 705 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  25.3 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  37.75 
 
 		 501 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  34.82 
 
 		 518 aa  80.1  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  31.2 
 
 		 525 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  25.85 
 
 		 555 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  30.65 
 
 		 525 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  26.69 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.86 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  28.16 
 
 		 741 aa  73.6  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 537 aa  73.6  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  28.5 
 
 		 520 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  34.36 
 
 		 514 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  21.43 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  34.23 
 
 		 538 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  40.4 
 
 		 558 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  38 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  26.09 
 
 		 739 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  35.23 
 
 		 520 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  38.14 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  33.59 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  21.35 
 
 		 740 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  47.54 
 
 		 561 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  29.2 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  30.41 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  34.44 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 514 aa  60.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  37.62 
 
 		 537 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  24.6 
 
 		 562 aa  60.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  38.96 
 
 		 502 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.96 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.9 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.96 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  40.23 
 
 		 543 aa  59.7  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  26.77 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.25 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 659 aa  58.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  22.4 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  32.58 
 
 		 616 aa  56.6  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 502 aa  56.6  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  30.61 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  29.95 
 
 		 518 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  34.23 
 
 		 609 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  28.11 
 
 		 554 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  23.34 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  23.55 
 
 		 518 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  26.49 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  35.44 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.71 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  40 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.1 
 
 		 601 aa  54.7  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  28.82 
 
 		 389 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  23.72 
 
 		 616 aa  54.3  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 552 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  27.64 
 
 		 553 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  30.77 
 
 		 485 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  36.07 
 
 		 383 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  29.17 
 
 		 359 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  26.17 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  27.41 
 
 		 619 aa  53.9  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  26.17 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  31.75 
 
 		 512 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  28.89 
 
 		 515 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  33.12 
 
 		 393 aa  53.1  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0495  CdaR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 645 aa  53.1  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.85 
 
 		 509 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  29.55 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  23.99 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  46.38 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  25.86 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  30 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  34.67 
 
 		 547 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  30.36 
 
 		 528 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  25.86 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  25.86 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  25.86 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  29.22 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2100  fis-type helix-turn-helix domain protein  30.59 
 
 		 287 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147633  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  30 
 
 		 492 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 517 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  32 
 
 		 454 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0203  carbohydrate diacid regulator  28.92 
 
 		 402 aa  51.2  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  33 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  33 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  43.04 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  33 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  23.48 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>